Métodos comparativos filogenéticos

Los métodos comparativos filogenéticos (PCM) utilizan información sobre las relaciones históricas de los linajes (filogenias) para probar hipótesis evolutivas.[1]​ Inicialmente, estos métodos se desarrollaron principalmente para controlar la historia filogenética al probar la adaptación;[2]​ sin embargo, en los últimos años, el uso del término se ha ampliado para incluir cualquier uso de las filogenias en las pruebas estadísticas.[3]​ Aunque la mayoría de los estudios que emplean PCM se centran en organismos existentes; muchos métodos también pueden aplicarse a taxones extintos y pueden incorporar información del registro fósil.Este enfoque es particularmente útil cuando hay poca o ninguna variación dentro de las especies.El algoritmo implica calcular valores en nodos internos como un paso intermedio, pero generalmente no se usan para inferencias por sí mismos.Por lo tanto, es la estructura de los residuos y no las propias variables las que muestran la señal filogenética.[15]​[16]​[17]​ Martins y Garland[9]​ propusieron en 1991 que una forma de explicar las relaciones filogenéticas al realizar análisis estadísticos era usar simulaciones por computadora para crear muchos conjuntos de datos que fueran consistentes con la hipótesis nula bajo prueba (por ejemplo, no hay correlación entre dos rasgos, no diferencia entre dos grupos de especies definidas ecológicamente) pero que imitan la evolución a lo largo del árbol filogenético relevante.Tales enfoques de simulación también se pueden combinar con métodos como los contrastes filogenéticamente independientes o PGLS.
Áreas de distribución doméstica de 49 especies de mamíferos en relación con su tamaño corporal . Las especies de cuerpo más grande tienden a tener rangos de hogar más grandes, pero para cada tamaño corporal, miembros del orden Carnivora ( carnívoros y omnívoros ) tienden a tener rangos de hogar más grandes que los ungulados (todos los cuales son herbívoros ). Si esta diferencia se considera estadísticamente significativa depende de qué tipo de análisis se aplique [ 7 ] ​
Masa de los testículos de varias especies de primates en relación con el tamaño de su cuerpo y el sistema de apareamiento. Las especies de cuerpo más grande tienden a tener testículos más grandes, pero en cualquier tipo de tamaño corporal, las especies en que las hembras tienden a aparearse con múltiples machos tienen machos con testículos más grandes.
Los contrastes estandarizados se utilizan en procedimientos estadísticos convencionales, con la restricción de que todas las regresiones , correlaciones , análisis de covarianza , etc., deben pasar por el origen.
Los datos para un rasgo de valor continuo se pueden simular de tal manera que los taxones en las puntas de un árbol filogenético hipotético exhibirán una señal filogenética, es decir, las especies estrechamente relacionadas tenderán a parecerse entre sí.