Bayona es además sede de la Comunidad de aglomeración del País Vasco, que engloba a casi todos los municipios del País Vasco francés.
Bayona fue fundada en el año 950 sobre las ruinas de un antiguo castrum romano, llamado Lapurdum, que ha dejado su nombre al territorio del Labort.
[4] En el siglo IX fue ocupada por los vikingos, lo que transmitió a sus habitantes los secretos de su construcción naval.
Anteriormente formaba una comuna autónoma dentro del departamento de Landas.
Está fundamentalmente basada en el comercio, la industria metalúrgica y la química.