La guerra estalló en gran medida por el hecho de que los tratados y acuerdos que se alcanzaron al final de la Guerra del rey Felipe (1675-1678) no se cumplieron.[5] Además, los ingleses se alarmaron de que los indios recibían ayuda francesa o quizás holandesa.Los indios se aprovecharon de los ingleses y sus miedos, haciéndoles parecer como si estuvieran con los franceses.[7] Asimismo, los Ingleses carecían de liderazgo militar y tenían una relación difícil con sus aliados Iroqueses.[7][8] Nueva Francia se dividía en tres entidades: Acadia en la costa atlántica; Canadá a lo largo del río San Lorenzo y hasta los Grandes Lagos; y Luisiana desde los Grandes Lagos hasta el Golfo de México, a lo largo del río Misisipi.Los iroqueses dominaban el comercio de pieles en los Grandes Lagos y estaban en conflicto con Nueva Francia desde 1680.Para asegurar la reclamación de Nueva Francia a la actual Maine, estableció misiones católicas entre los tres pueblos nativos más grandes de la región: uno en el río Kennebec (Norridgewock); otro más al norte en el río Penobscot (Penobscot) y una en el Río Saint John (Medoctec).[15]: 81 Nueva Inglaterra se vengó de estas redadas enviando al coronel Benjamin Church para atacar Acadia.[16]: 33 Church luego regresó a Boston dejando al pequeño grupo de colonos ingleses sin protección.[18] Phips llegó con 736 hombres de Nueva Inglaterra en siete barcos ingleses.El gobernador Louis-Alexandre des Friches de Menneval luchó durante dos días y luego capituló.La guarnición fue encarcelada en la iglesia, y el gobernador de Méneval fue confinado a su casa.[19] Los residentes de Port Royal fueron obligados a jurar lealtad al rey.[18] Los marineros quemaron y saquearon el asentamiento, incluyendo la iglesia parroquial.Su misión era aliviar Fort Pejpescot (actual Brunswick, Maine), que había sido tomada por la Confederación Wabanaki.[16] A partir de ahí siguió 40 millas (64 km) río arriba para Livermore Falls y atacó una aldea.Church descubrió cinco cautivos ingleses en las tiendas indias, masacró a seis o siete nativos y tomó nueve presos.[16] El 26 de septiembre, Church volvió a Portsmouth, Nueva Hampshire.Pero el capitán James Converse y su milicia defendieron con éxito la guarnición del teniente José Storer, que estaba rodeado por una empalizada.La tercera expedición de Church a Acadia durante la guerra fue en 1692 cuando se saqueo Penobscot (actual isla india, Maine) con 450 hombres.También en agosto de 1689, 1500 Iroqueses, buscando venganza por las acciones del Gobernador General Denonville, atacaron el asentamiento francés en Lachine.