El municipio se caracteriza por tener una población 100% de raza (etnia) indígena.

[3]​ Fue fundado como una de las reducciones o «doctrinas», por los frailes franciscanos durante la época colonial.

La palabra «Quechelaj» proviene del idioma kakchikel y significa «Río de espinas».

Al llegar los conquistadores españoles al área en que se encontraba el poblado, decidieron llamarle «Nuestra Señora de La Concepción» en honor a la Virgen de la Concepción.

[15]​ En ese año, la Asamblea Legislativa del Estado también dividió al Estado de Guatemala en once distritos para la impartición de justicia, y Concepción fue parte del circuito de Sololá en el distrito N.º7 (Sololá), el cual incluía también a Panajachel, San Andrés, Santa Catarina Palopó, San Antonio Palopó, San Jorge, Santa Cruz, Santa Lucía Utatlán, Santa Catarina Istaguacán y Argueta.

Encolerizados, los indígenas acudieron al caudillo conservador Rafael Carrera, en busca de protección.

[17]​ Tras algunas escaramuzas, los ejércitos se enfrentaron en Sololá el 25 de enero de 1840; Carrera venció a las fuerzas del general Agustín Guzmán e incluso apresó a este[18]​ mientras que el general Doroteo Monterrosa venció a las fuerzas altenses del coronel Antonio Corzo el 28 de enero.

Al saber el hecho, una turba enardecida atacó al alcalde —quien se había refugiado en su casa y creía esta en un lugar seguro— hasta darle muerte, y la Policía Nacional Civil tuvo que enviar a un batallón de elementos para retomar el control del municipio.