Durante el periodo 1997-1998 presidió la Comisión el congresista Enrique Chirinos Soto.
En el periodo parlamentario 2000-2001, fue elegido presidente el congresista Ricardo Marcenaro Frers.
En el periodo parlamentario 2001-2006 la Comisión pasó a denominarse Comisión de Constitución, Reglamento y Acusaciones Constitucionales en el periodo 2001-2002 y 2002-2003.
En el periodo parlamentario 2006-2011 presidieron la Comisión los congresistas Aurelio Pastor (2006-2007 y 2010-2011), Javier Velásquez Quesquén (2007-2008), José Vargas Fernández (2008-2009) y Mercedes Cabanillas Bustamante (2009-2010).
Durante el Periodo parlamentario 2016-2021, presidieron la Comisión los congresistas Miguel Torres Morales (2016-2017), Úrsula Letona (2017-2018), Rosa Bartra (2018-2019, 2019), Omar Chehade (2020-2021) y Luis Valdez Farías (2021).