Involucrada en las actividades del Partido Popular Cristiano desde su juventud, Flores postuló en 1985 por primera vez al Congreso de la República sin éxito.

[4]​[5]​ Tras la caída del régimen fujimorista, Flores se presentó a la presidencia en 2001 y 2006, ocupando en ambas ocasiones el tercer lugar de las votaciones y siendo desplazada del balotaje por un estrecho margen a manos de Alan García.

En 1977, Flores ingresó a la Pontificia Universidad Católica del Perú, donde siguió la carrera de Derecho.

Durante su periodo en la universidad, se involucró en política universitaria, optando por el socialcristianismo.

El movimiento universitario estaba circunscrito entonces a las confrontaciones ideológicas entre jóvenes apristas e izquierdistas.

Ha ejercido la abogacía en forma independiente desde su inicio profesional como titular de su propio estudio, donde se dedica a las áreas civil y mercantil.

Flores se desempeña como vicepresidenta de la Internacional Demócrata de Centro,[23]​ una red política internacional demócrata cristiana y como miembro del think tank con sede en Washington D. C., Diálogo Interamericano.

Su compromiso con los ideales socialcristianos y el perfil de joven líder la llevó a ser Secretaria General del PPC en 1993.

Desde esa posición mantuvo una activa imagen pública, que se acrecentó notoriamente con su participación en la campaña contra la estatización de la banca en 1987, posición defendida por el expresidente Alan García y la mayoría en el Congreso.

Los resultados darían como ganador al Movimiento Cívico Independiente OBRAS, liderado por el presentador de televisión Ricardo Belmont.

Obtendría un rol importante al ser incorporada, junto con Pedro Cateriano, Fausto Alvarado y Jorge del Castillo, como miembro de la Comisión Investigadora al primer gobierno del expresidente Alan García, presidida por el entonces diputado Fernando Olivera.

Durante el golpe, Flores convocó a los diputados opositores para discutir la situación política.

Luego del golpe estado, Fujimori convocó a elecciones constituyentes en 1992 para la creación de una nueva constitución y Flores Nano junto con Luis Bedoya Reyes deseaban que el PPC integre dicho grupo.

El resultado fue la renuncia de Alberto Andrade y Alberto Borea Odría al anunciarse que el Partido Popular Cristiano iría al Congreso Constituyente Democrático a pedido de Flores Nano, respaldada por Luis Bedoya Reyes.

Dicha comisión elaboraba el Proyecto para la que sería la Constitución de 1993.

Junto con la congresista Anel Townsend, propuso un referéndum para debatir la candidatura de Alberto Fujimori, e incluso su hija Keiko Fujimori firmó uno de los planillones que se remitirían a la ONPE para que se proceda con la consulta popular.

Por este hecho durante la campaña presidencial del 2006 sus adversarios la llamaron peyorativamente Miss Tiwinza.

En agosto del 2005, Ollanta Humala de Gana Perú empezó un inesperado ascenso en las encuestas.

A partir de febrero del 2006, Flores Nano comenzó una campaña publicitaria, teniendo como logo su lema «El Perú en manos firmes».

Fue descalificada por sus opositores refiriéndose a Flores como la «candidata de los ricos», frase acuñada por Alan García y sus partidarios contra ella, mientras miembros de Unidad Nacional denunciaban una guerra sucia orquestada por el APRA y por Gana Perú para perjudicar directamente a Flores.

[2]​ Luego de que Salvador Heresi fuera voceado fuertemente como candidato del Partido Popular Cristiano a la alcaldía de Lima, el partido finalmente propone con insistencia la candidatura de Lourdes Flores para la alcaldía; ella respondería que aceptaría la decisión final del partido.

Inicialmente la campaña se polarizaría entre Flores y Alex Kouri, que había renunciado a la Presidencia del Callao para participar en la contienda.

Sin embargo, en otra entrevista televisiva días antes de la elección, afirmaría que lo evaluaría por no saberlo bien.

En diciembre del 2015, anunció su candidatura a la primera Vicepresidencia de la República en la fórmula presidencial de Alan García por la Alianza Popular,[44]​ coalición conformada entre el Partido Popular Cristiano y el APRA para las elecciones generales del 2016.

Al verse acorralado, Cánepa quiso negociar con la fiscalía y convertirse en colaborador eficaz, delatando el manejo de los otros árbitros; sin embargo, la fiscalía consideró que ese tipo de delación solo calificaba para una confesión sincera.

Para postular a la colaboración eficaz debía revelar sobre quienes estuvieran en niveles por encima de él.

[52]​ Fue entonces cuando Cánepa, en su desesperación, se propuso hacer una delación más prominente: de acuerdo a su versión, Lourdes Flores, como lideresa del PPC, pidió dinero a la constructora Odebrecht para financiar sus campañas electorales, que le fue concedido.

Negó tajantemente que ella pidiera dinero a Odebrecht, tal como afirmaba Cánepa.

El fiscal José Domingo Pérez solicitó entonces que se le abriera una investigación preliminar, al existir indicios de haber recibido dinero ilícito.

[55]​ En septiembre, la fiscal Carol Cuba Peralta ha incorporado en la investigación preliminar al expresidente del Comité Organizador de los Juegos Panamericanos Lima 2019, Carlos Neuhaus Tudela; al excongresista de la alianza Unidad Nacional-PPC, Hildebrando Tapia y a Teresa Cánova Sarango, la asesora de la exlideresa del partido, Lourdes Flores.