Representación fotográfica del conjunto cromosómico total en una célula
Un cariotipo es la apariencia general del conjunto completo de cromosomas en las células de una especie o en un organismo individual, incluyendo principalmente sus tamaños, números y formas. [1] [2] El cariotipo es el proceso mediante el cual se discierne un cariotipo determinando el complemento cromosómico de un individuo, incluyendo el número de cromosomas y cualquier anomalía.
Un cariograma o idiograma es una representación gráfica de un cariotipo, en el que los cromosomas generalmente se organizan en pares, ordenados por tamaño y posición del centrómero para los cromosomas del mismo tamaño. El cariotipo generalmente combina la microscopía óptica y la fotografía en la metafase del ciclo celular , y da como resultado un cariograma fotomicrográfico (o simplemente micrográfico). Por el contrario, un cariograma esquemático es una representación gráfica diseñada de un cariotipo. En los cariogramas esquemáticos, generalmente se muestra solo una de las cromátidas hermanas de cada cromosoma para abreviar, y en realidad generalmente están tan juntas que también parecen una en las fotomicrografías a menos que la resolución sea lo suficientemente alta como para distinguirlas. El estudio de conjuntos completos de cromosomas a veces se conoce como cariología .
Los cariotipos describen el recuento de cromosomas de un organismo y el aspecto que estos cromosomas tienen bajo un microscopio óptico . Se presta atención a su longitud, la posición de los centrómeros , el patrón de bandas, las diferencias entre los cromosomas sexuales y cualquier otra característica física. [3] La preparación y el estudio de los cariotipos es parte de la citogenética .
El número básico de cromosomas en las células somáticas de un individuo o una especie se denomina número somático y se designa 2n . En la línea germinal (las células sexuales) el número de cromosomas es n (humanos: n = 23). [4] [5] p28 Por lo tanto, en los humanos 2n = 46.
Por lo tanto, en los organismos diploides normales , los cromosomas autosómicos están presentes en dos copias. Puede haber cromosomas sexuales o no . Las células poliploides tienen múltiples copias de cromosomas y las células haploides tienen una sola copia.
Generalmente se observan y comparan seis características diferentes de los cariotipos: [10]
Diferencias en el tamaño absoluto de los cromosomas. Los cromosomas pueden variar en tamaño absoluto hasta veinte veces entre géneros de la misma familia. Por ejemplo, las leguminosas Lotus tenuis y Vicia faba tienen seis pares de cromosomas cada una, mientras que los cromosomas de V. faba son mucho más grandes. Estas diferencias probablemente reflejen diferentes cantidades de duplicación de ADN.
Diferencias en la posición de los centrómeros . Estas diferencias probablemente se produjeron a través de translocaciones .
Diferencias en el tamaño relativo de los cromosomas. Estas diferencias probablemente surgieron del intercambio de segmentos de longitudes desiguales.
Diferencias en el número básico de cromosomas. Estas diferencias podrían haber resultado de translocaciones desiguales sucesivas que eliminaron todo el material genético esencial de un cromosoma, permitiendo su pérdida sin penalización para el organismo (la hipótesis de la dislocación) o a través de la fusión. Los humanos tienen un par de cromosomas menos que los grandes simios. El cromosoma humano 2 parece haber resultado de la fusión de dos cromosomas ancestrales, y muchos de los genes de esos dos cromosomas originales han sido translocados a otros cromosomas.
Diferencias en el número y la posición de los satélites. Los satélites son pequeños cuerpos unidos a un cromosoma mediante un hilo fino.
Diferencias en el grado y distribución del contenido de GC ( pares Guanina - Citosina versus Adenina - Timina ). En la metafase donde típicamente se estudia el cariotipo, todo el ADN está condensado, pero la mayoría de las veces, el ADN con un alto contenido de GC suele estar menos condensado, es decir, tiende a aparecer como eucromatina en lugar de heterocromatina . El ADN rico en GC tiende a contener más ADN codificante y ser más activo transcripcionalmente . [11] El ADN rico en GC es más claro en la tinción de Giemsa . [12] Las regiones de eucromatina contienen mayores cantidades de pares Guanina - Citosina (es decir, tiene un mayor contenido de GC ). La técnica de tinción que utiliza la tinción de Giemsa se llama bandas G y, por lo tanto, produce las típicas "Bandas G". [12]
Por lo tanto, una descripción completa de un cariotipo puede incluir el número, el tipo, la forma y las bandas de los cromosomas, así como otra información citogenética.
Tanto los cariogramas micrográficos como los esquemáticos que se muestran en esta sección tienen una disposición cromosómica estándar y muestran regiones más oscuras y más claras como se ve en las bandas G , que es la apariencia de los cromosomas después del tratamiento con tripsina (para digerir parcialmente los cromosomas) y la tinción con tinción de Giemsa . En comparación con las regiones más oscuras, las regiones más claras son generalmente más activas transcripcionalmente , con una mayor proporción de ADN codificante frente a ADN no codificante y un mayor contenido de GC . [11]
Tanto el cariograma micrográfico como el esquemático muestran el cariotipo diploide humano normal , que es la composición típica del genoma dentro de una célula normal del cuerpo humano, y que contiene 22 pares de cromosomas autosómicos y un par de cromosomas sexuales (alosomas). Una excepción importante a la diploidía en humanos son los gametos (espermatozoides y óvulos) que son haploides con 23 cromosomas no apareados, y esta ploidía no se muestra en estos cariogramas. El cariograma micrográfico se convierte a escala de grises , mientras que el cariograma esquemático muestra el tono púrpura que se ve típicamente en la tinción de Giemsa (y es el resultado de su componente B azul, que tiñe el ADN de púrpura). [14]
El cariograma esquemático de esta sección es una representación gráfica del cariotipo idealizado. Para cada par de cromosomas, la escala de la izquierda muestra la longitud en términos de millones de pares de bases , y la escala de la derecha muestra las designaciones de las bandas y subbandas . El Sistema Internacional de Nomenclatura Citogenómica Humana utiliza dichas bandas y subbandas para describir la ubicación de las anomalías cromosómicas. Cada fila de cromosomas está alineada verticalmente a nivel del centrómero .
Grupos de cromosomas humanos
Con base en las características del cariograma: tamaño, posición del centrómero y en ocasiones la presencia de un satélite cromosómico (un segmento distal a una constricción secundaria ), los cromosomas humanos se clasifican en los siguientes grupos: [15]
Alternativamente, el genoma humano puede clasificarse de la siguiente manera, en función del emparejamiento, las diferencias sexuales y la ubicación dentro del núcleo celular frente al interior de las mitocondrias :
22 pares de cromosomas autosómicos homólogos (cromosomas 1 a 22). Homólogo significa que tienen los mismos genes en los mismos loci y autosómico significa que no son cromosomas sexuales.
Dos cromosomas sexuales (en el rectángulo verde en la parte inferior derecha del cariograma esquemático, con siluetas adyacentes de fenotipos representativos típicos ): los cariotipos más comunes para las mujeres contienen dos cromosomas X y se denominan 46,XX; los hombres suelen tener un cromosoma X y un cromosoma Y denominados 46,XY. Sin embargo, aproximadamente el 0,018% de los humanos son intersexuales , a veces debido a variaciones en los cromosomas sexuales. [16]
El genoma mitocondrial humano (mostrado abajo a la izquierda en el cariograma esquemático, a escala en comparación con el ADN nuclear en términos de pares de bases ), aunque no se incluye en los cariogramas micrográficos en la práctica clínica. Su genoma es relativamente diminuto en comparación con el resto.
Número de copia
Los cariogramas esquemáticos generalmente muestran un número de copias de ADN correspondiente a la fase G 0 del estado celular (fuera del ciclo celular replicativo ), que es el estado más común de las células. El cariograma esquemático de esta sección también muestra este estado. En este estado (así como durante la fase G 1 del ciclo celular ), cada célula tiene 2 cromosomas autosómicos de cada tipo (designados 2n), donde cada cromosoma tiene una copia de cada locus , lo que hace un número total de copias de 2 para cada locus (2c). En la parte superior central del cariograma esquemático, también se muestra el par de cromosomas 3 después de haber sufrido la síntesis de ADN , que ocurre en la fase S (anotada como S) del ciclo celular. Este intervalo incluye la fase G 2 y la metafase (anotada como "Meta"). Durante este intervalo, todavía hay 2n, pero cada cromosoma tendrá 2 copias de cada locus, en donde cada cromátida hermana (brazo cromosómico) está conectada en el centrómero, para un total de 4c. [17] Los cromosomas en los cariogramas micrográficos también están en este estado, porque generalmente se micrografían en metafase, pero durante esta fase las dos copias de cada cromosoma están tan cerca una de la otra que aparecen como una sola a menos que la resolución de la imagen sea lo suficientemente alta para distinguirlas. En realidad, durante las fases G 0 y G 1 , el ADN nuclear se dispersa como cromatina y no muestra cromosomas visualmente distinguibles incluso en la micrografía.
El número de copias del genoma mitocondrial humano por célula humana varía desde 0 (eritrocitos) [18] hasta 1.500.000 ( ovocitos ), dependiendo principalmente del número de mitocondrias por célula. [19]
Diversidad y evolución de los cariotipos
Aunque la replicación y transcripción del ADN está altamente estandarizada en los eucariotas , no se puede decir lo mismo de sus cariotipos, que son muy variables. Existe variación entre especies en el número de cromosomas y en la organización detallada, a pesar de que están construidas a partir de las mismas macromoléculas . Esta variación proporciona la base para una variedad de estudios en citología evolutiva .
En algunos casos, incluso hay una variación significativa dentro de las especies. En una revisión, Godfrey y Masters concluyen:
En nuestra opinión, es poco probable que un proceso u otro puedan explicar de forma independiente la amplia gama de estructuras cariotípicas que se observan... Pero, utilizada en conjunción con otros datos filogenéticos, la fisión cariotípica puede ayudar a explicar diferencias dramáticas en los números diploides entre especies estrechamente relacionadas, que anteriormente eran inexplicables. [20]
Aunque se sabe mucho sobre los cariotipos a nivel descriptivo, y está claro que los cambios en la organización del cariotipo han tenido efectos en el curso evolutivo de muchas especies, no está del todo claro cuál podría ser su significado general.
Tenemos una comprensión muy pobre de las causas de la evolución del cariotipo, a pesar de muchas investigaciones cuidadosas... el significado general de la evolución del cariotipo es oscuro.
—Maynard Smith [21]
Cambios durante el desarrollo
En lugar de la represión genética habitual, algunos organismos optan por la eliminación a gran escala de la heterocromatina u otros tipos de ajustes visibles del cariotipo.
Eliminación de cromosomas. En algunas especies, como en muchas moscas esciáridas , se eliminan cromosomas enteros durante el desarrollo. [22]
Disminución de la cromatina (padre fundador: Theodor Boveri ). En este proceso, que se da en algunos copépodos y gusanos redondos como Ascaris suum , se eliminan porciones de los cromosomas en determinadas células. Este proceso es una reorganización del genoma cuidadosamente organizada en la que se construyen nuevos telómeros y se pierden ciertas regiones de heterocromatina. [23] [24] En A. suum , todos los precursores de células somáticas sufren una disminución de la cromatina. [25]
Un ejemplo espectacular de variabilidad entre especies estrechamente relacionadas es el muntjac , que fue investigado por Kurt Benirschke y Doris Wurster. Se descubrió que el número diploide del muntjac chino, Muntiacus reevesi , era de 46, todos telocéntricos . Cuando observaron el cariotipo del muntjac indio estrechamente relacionado, Muntiacus muntjak , se sorprendieron al descubrir que tenía cromosomas femeninos = 6, masculinos = 7. [28]
Simplemente no podían creer lo que veían... Se quedaron en silencio durante dos o tres años porque pensaban que algo andaba mal con su cultivo de tejidos... Pero cuando obtuvieron un par de muestras más confirmaron [sus hallazgos].
— Hsu pág. 73-4 [29]
El número de cromosomas en el cariotipo entre especies (relativamente) no relacionadas es enormemente variable. El récord más bajo lo ostenta el nematodo Parascaris univalens , donde el haploide n = 1; y una hormiga: Myrmecia pilosula . [30] El récord más alto estaría en algún lugar entre los helechos , con el helecho lengua de víbora Ophioglossum a la cabeza con un promedio de 1262 cromosomas. [31] La puntuación más alta para los animales podría ser el esturión de hocico corto Acipenser brevirostrum con 372 cromosomas. [32] La existencia de cromosomas supernumerarios o B significa que el número de cromosomas puede variar incluso dentro de una población cruzada; y los aneuploides son otro ejemplo, aunque en este caso no se considerarían miembros normales de la población.
Número fundamental
El número fundamental, FN , de un cariotipo es el número de brazos cromosómicos mayores visibles por conjunto de cromosomas. [33] [34] Por lo tanto, FN ≤ 2 x 2n, la diferencia depende del número de cromosomas considerados de un solo brazo ( acrocéntricos o telocéntricos ) presentes. Los humanos tienen FN = 82, [35] debido a la presencia de cinco pares de cromosomas acrocéntricos: 13 , 14 , 15 , 21 y 22 (el cromosoma Y humano también es acrocéntrico). El número autosómico fundamental o número fundamental autosómico, FNa [36] o AN , [37] de un cariotipo es el número de brazos cromosómicos mayores visibles por conjunto de autosomas ( cromosomas no ligados al sexo ).
Ploidía
La ploidía es el número de juegos completos de cromosomas en una célula.
La poliploidía , donde hay más de dos juegos de cromosomas homólogos en las células, ocurre principalmente en plantas. Ha sido de gran importancia en la evolución de las plantas según Stebbins . [38] [39] [40] [41] Stebbins estimó que la proporción de plantas con flores que son poliploides era del 30 al 35 %, pero en las gramíneas el promedio es mucho más alto, alrededor del 70 %. [42] La poliploidía en plantas inferiores ( helechos , colas de caballo y psilotales ) también es común, y algunas especies de helechos han alcanzado niveles de poliploidía muy superiores a los niveles más altos conocidos en plantas con flores. La poliploidía en animales es mucho menos común, pero ha sido significativa en algunos grupos. [43]
Las series poliploides en especies relacionadas que consisten enteramente en múltiplos de un solo número básico se conocen como euploides .
La endopoliploidía ocurre cuando en los tejidos adultos diferenciados las células han dejado de dividirse por mitosis , pero los núcleos contienen más que el número somático original de cromosomas . [44] En el endociclo ( endomitosis o endorreduplicación ) los cromosomas en un núcleo "en reposo" experimentan reduplicación , y los cromosomas hijos se separan unos de otros dentro de una membrana nuclear intacta . [45] En muchos casos, los núcleos endopoliploides contienen decenas de miles de cromosomas (que no se pueden contar con exactitud). Las células no siempre contienen múltiplos exactos (potencias de dos), por lo que la definición simple "un aumento en el número de conjuntos de cromosomas causado por la replicación sin división celular" no es del todo precisa. Este proceso (especialmente estudiado en insectos y algunas plantas superiores como el maíz) puede ser una estrategia de desarrollo para aumentar la productividad de los tejidos que son muy activos en la biosíntesis. [46] El fenómeno ocurre esporádicamente en todo el reino eucariota , desde los protozoos hasta los humanos; es diverso y complejo, y sirve a la diferenciación y morfogénesis de muchas maneras. [47]
Véase paleopoliploidía para la investigación de duplicaciones de cariotipos antiguos.
Aneuploidía
La aneuploidía es una afección en la que el número de cromosomas en las células no es el típico para la especie. Esto daría lugar a una anomalía cromosómica, como un cromosoma adicional o la pérdida de uno o más cromosomas. Las anomalías en el número de cromosomas suelen provocar un defecto en el desarrollo. El síndrome de Down y el síndrome de Turner son ejemplos de ello.
La aneuploidía también puede ocurrir dentro de un grupo de especies estrechamente relacionadas. Ejemplos clásicos en plantas son el género Crepis , donde los números gaméticos (= haploides) forman la serie x = 3, 4, 5, 6 y 7; y Crocus , donde cada número de x = 3 a x = 15 está representado por al menos una especie. Evidencias de varios tipos muestran que las tendencias de la evolución han ido en diferentes direcciones en diferentes grupos. [48] En los primates, los grandes simios tienen 24x2 cromosomas mientras que los humanos tienen 23x2. El cromosoma humano 2 se formó por una fusión de cromosomas ancestrales, reduciendo el número. [49]
Polimorfismo cromosómico
Algunas especies son polimórficas para diferentes formas estructurales de cromosomas. [50] La variación estructural puede estar asociada con diferentes números de cromosomas en diferentes individuos, lo que ocurre en la mariquita Chilocorus stigma , algunas mantis del género Ameles , [51] la musaraña europea Sorex araneus . [52] Hay alguna evidencia del caso del molusco Thais lapillus (el caracol de mar ) en la costa de Bretaña , de que los dos morfos cromosómicos están adaptados a diferentes hábitats. [53]
Árboles de especies
El estudio detallado de las bandas cromosómicas en insectos con cromosomas politénicos puede revelar relaciones entre especies estrechamente relacionadas: el ejemplo clásico es el estudio de las bandas cromosómicas en los drosófilos hawaianos realizado por Hampton L. Carson .
En una superficie de aproximadamente 17 000 km2 , las islas hawaianas albergan la colección más diversa de moscas drosófilas del mundo, que habitan desde selvas tropicales hasta praderas subalpinas . Estas aproximadamente 800 especies hawaianas de drosófilas suelen asignarse a dos géneros, Drosophila y Scaptomyza , de la familia Drosophilidae .
Las bandas politénicas del grupo de las "alas pictóricas", el grupo de drosófilas hawaianas mejor estudiado, permitieron a Carson elaborar el árbol evolutivo mucho antes de que el análisis del genoma fuera posible. En cierto sentido, las disposiciones de los genes son visibles en los patrones de bandas de cada cromosoma. Los reordenamientos cromosómicos, especialmente las inversiones , permiten ver qué especies están estrechamente relacionadas.
Los resultados son claros. Las inversiones, cuando se representan en forma de árbol (e independientemente de toda otra información), muestran un claro "flujo" de especies desde islas más antiguas a islas más nuevas. También hay casos de colonización de regreso a islas más antiguas y de saltos de islas, pero estos son mucho menos frecuentes. Usando la datación K-Ar , las islas actuales datan de hace 0,4 millones de años ( Mauna Kea ) a 10 millones de años ( Necker ). El miembro más antiguo del archipiélago hawaiano que aún se encuentra sobre el mar es el atolón de Kure , que puede datarse en 30 millones de años. El archipiélago en sí (producido por la placa del Pacífico que se mueve sobre un punto caliente ) ha existido durante mucho más tiempo, al menos hasta el Cretácico . Las islas anteriores que ahora están bajo el mar ( guyots ) forman la cadena de montes submarinos Emperador . [54]
Todas las especies nativas de Drosophila y Scaptomyza en Hawái aparentemente descienden de una única especie ancestral que colonizó las islas, probablemente hace 20 millones de años. La radiación adaptativa posterior fue estimulada por la falta de competencia y una amplia variedad de nichos . Aunque sería posible que una sola hembra grávida colonizara una isla, es más probable que haya sido un grupo de la misma especie. [55] [56] [57] [58]
Hay otros animales y plantas en el archipiélago hawaiano que han sufrido radiaciones adaptativas similares, aunque menos espectaculares. [59] [60]
Bandas cromosómicas
Los cromosomas presentan un patrón de bandas cuando se tratan con ciertas tinciones. Las bandas son franjas claras y oscuras alternadas que aparecen a lo largo de los cromosomas. Se utilizan patrones de bandas únicos para identificar cromosomas y diagnosticar aberraciones cromosómicas, incluidas roturas, pérdidas, duplicaciones, translocaciones o segmentos invertidos de cromosomas. Una variedad de diferentes tratamientos de cromosomas produce una variedad de patrones de bandas: bandas G, bandas R, bandas C, bandas Q, bandas T y bandas NOR.
Representación de cariotipos
Tipos de bandas
La citogenética emplea varias técnicas para visualizar diferentes aspectos de los cromosomas: [9]
La formación de bandas G se obtiene con la tinción de Giemsa después de la digestión de los cromosomas con tripsina . Produce una serie de bandas teñidas claras y oscuras: las regiones oscuras tienden a ser heterocromáticas, de replicación tardía y ricas en AT. Las regiones claras tienden a ser eucromáticas, de replicación temprana y ricas en GC. Este método normalmente producirá entre 300 y 400 bandas en un genoma humano normal . Es el método de formación de bandas cromosómicas más común. [61]
La banda R es la inversa de la banda G (la R significa "inversa"). Las regiones oscuras son eucromáticas (regiones ricas en guanina y citosina) y las regiones brillantes son heterocromáticas (regiones ricas en timina y adenina).
Bandas C: Giemsa se une a la heterocromatina constitutiva , por lo que tiñe los centrómeros . El nombre se deriva de heterocromatina centromérica o constitutiva. Las preparaciones se someten a una desnaturalización alcalina antes de la tinción, lo que conduce a una despurinización casi completa del ADN. Después de lavar la sonda, el ADN restante se renaturaliza nuevamente y se tiñe con una solución de Giemsa que consiste en azur de metileno, violeta de metileno, azul de metileno y eosina. La heterocromatina se une a una gran cantidad del tinte, mientras que el resto de los cromosomas absorben solo una pequeña cantidad. La unión C resultó ser especialmente adecuada para la caracterización de los cromosomas de las plantas.
El patrón de bandas Q es un patrón fluorescente obtenido utilizando quinacrina para la tinción. El patrón de bandas es muy similar al que se observa en las bandas G. Se pueden reconocer por una fluorescencia amarilla de diferente intensidad. La mayor parte del ADN teñido es heterocromatina. La quinacrina (atebrina) se une a las regiones ricas en AT y en GC, pero solo el complejo AT-quinacrina emite fluorescencia. Dado que las regiones ricas en AT son más comunes en la heterocromatina que en la eucromatina, estas regiones se marcan preferentemente. Las diferentes intensidades de las bandas individuales reflejan los diferentes contenidos de AT. Otros fluorocromos como DAPI o Hoechst 33258 también dan lugar a patrones característicos y reproducibles. Cada uno de ellos produce su patrón específico. En otras palabras: las propiedades de los enlaces y la especificidad de los fluorocromos no se basan exclusivamente en su afinidad por las regiones ricas en AT. Más bien, la distribución de AT y la asociación de AT con otras moléculas como las histonas, por ejemplo, influyen en las propiedades de unión de los fluorocromos.
Tinción de plata: el nitrato de plata tiñe la proteína asociada a la región de organización nucleolar . Esto produce una región oscura donde se deposita la plata, lo que denota la actividad de los genes del ARNr dentro de la región de organización nucleolar.
Los cariotipos se organizan con el brazo corto del cromosoma en la parte superior y el brazo largo en la parte inferior. Algunos cariotipos denominan a los brazos corto y largo p y q , respectivamente. Además, las regiones y subregiones teñidas de forma diferente reciben designaciones numéricas de proximal a distal en los brazos cromosómicos. Por ejemplo, el síndrome de Cri du chat implica una deleción en el brazo corto del cromosoma 5. Se escribe como 46,XX,5p-. La región crítica para este síndrome es la deleción de p15.2 (el locus en el cromosoma), que se escribe como 46,XX,del(5)(p15.2). [62]
Cariotipo FISH Multicolor (mFISH) y espectral (técnica SKY)
La FISH multicolor y el cariotipo espectral más antiguo son técnicas citogenéticas moleculares que se utilizan para visualizar simultáneamente todos los pares de cromosomas de un organismo en diferentes colores. Las sondas marcadas con fluorescencia para cada cromosoma se crean marcando el ADN específico de cada cromosoma con diferentes fluoróforos . Debido a que existe un número limitado de fluoróforos espectralmente distintos, se utiliza un método de etiquetado combinatorio para generar muchos colores diferentes. Las combinaciones de fluoróforos se capturan y analizan mediante un microscopio de fluorescencia utilizando hasta 7 filtros de fluorescencia de banda estrecha o, en el caso del cariotipo espectral, utilizando un interferómetro conectado a un microscopio de fluorescencia. En el caso de una imagen mFISH, cada combinación de fluorocromos de las imágenes originales resultantes se reemplaza por un pseudocolor en un software de análisis de imágenes dedicado. De este modo, se pueden visualizar e identificar cromosomas o secciones de cromosomas, lo que permite el análisis de reordenamientos cromosómicos. [63]
En el caso del cariotipo espectral, el software de procesamiento de imágenes asigna un pseudocolor a cada combinación espectralmente diferente, lo que permite la visualización de los cromosomas coloreados individualmente. [64]
La hibridación in situ (FISH) multicolor se utiliza para identificar aberraciones cromosómicas estructurales en células cancerosas y otras enfermedades cuando la banda de Giemsa u otras técnicas no son lo suficientemente precisas.
Cariotipo digital
El cariotipo digital es una técnica que se utiliza para cuantificar el número de copias de ADN a escala genómica. Se aíslan y enumeran secuencias cortas de ADN de loci específicos de todo el genoma. [65] Este método también se conoce como cariotipo virtual . Mediante esta técnica, es posible detectar pequeñas alteraciones en el genoma humano, que no se pueden detectar mediante métodos que emplean cromosomas en metafase. Se sabe que algunas deleciones de loci están relacionadas con el desarrollo del cáncer. Dichas deleciones se encuentran mediante el cariotipo digital utilizando los loci asociados con el desarrollo del cáncer. [66]
Anomalías cromosómicas
Las anomalías cromosómicas pueden ser numéricas, como la presencia de cromosomas adicionales o faltantes, o estructurales, como en el caso de cromosomas derivados , translocaciones , inversiones , deleciones a gran escala o duplicaciones. Las anomalías numéricas, también conocidas como aneuploidía , a menudo ocurren como resultado de la no disyunción durante la meiosis en la formación de un gameto ; las trisomías , en las que hay tres copias de un cromosoma en lugar de las dos habituales, son anomalías numéricas comunes. Las anomalías estructurales a menudo surgen de errores en la recombinación homóloga . Ambos tipos de anomalías pueden ocurrir en los gametos y, por lo tanto, estarán presentes en todas las células del cuerpo de una persona afectada, o pueden ocurrir durante la mitosis y dar lugar a un individuo con mosaico genético que tiene algunas células normales y algunas anormales.
En los humanos
Las anomalías cromosómicas que provocan enfermedades en los seres humanos incluyen:
La trisomía 9 , considerada la cuarta trisomía más común, afecta a muchos individuos longevos, pero solo en una forma distinta a la de una trisomía completa, como el síndrome de trisomía 9p o la trisomía 9 en mosaico. A menudo funcionan bastante bien, pero tienden a tener problemas con el habla.
También se han documentado la trisomía 8 y la trisomía 16, aunque generalmente no sobreviven hasta el nacimiento.
Algunos trastornos surgen de la pérdida de solo una parte de un cromosoma, incluidos
Cri du chat (grito del gato), proveniente de un brazo corto truncado en el cromosoma 5. El nombre proviene del llanto distintivo de los bebés, causado por la formación anormal de la laringe.
Síndrome de Angelman : en el 50% de los casos falta un segmento del brazo largo del cromosoma 15; una deleción de los genes maternos, ejemplo de trastorno de impronta .
Síndrome de Prader-Willi : en el 50% de los casos falta un segmento del brazo largo del cromosoma 15; una deleción de los genes paternos, ejemplo de trastorno de impronta.
Los cromosomas fueron observados por primera vez en células vegetales por Carl Wilhelm von Nägeli en 1842. Su comportamiento en células animales ( salamandras ) fue descrito por Walther Flemming , el descubridor de la mitosis , en 1882. El nombre fue acuñado por otro anatomista alemán, Heinrich von Waldeyer en 1888. Es neolatín del griego antiguo κάρυον karyon , "grano", "semilla" o "núcleo", y τύπος typos , "forma general")
La siguiente etapa tuvo lugar después del desarrollo de la genética a principios del siglo XX, cuando se apreció que los cromosomas (que pueden observarse mediante el cariotipo) eran los portadores de genes. El término cariotipo, definido por la apariencia fenotípica de los cromosomas somáticos , en contraste con su contenido genético , fue introducido por Grigory Levitsky , quien trabajó con Lev Delaunay, Sergei Navashin y Nikolai Vavilov . [67] [68] [69] [70] La historia posterior del concepto se puede seguir en los trabajos de CD Darlington [71] y Michael JD White . [4] [13]
La investigación sobre el cariotipo humano tardó muchos años en resolver la pregunta más básica: ¿cuántos cromosomas contiene una célula humana diploide normal? [72] En 1912, Hans von Winiwarter informó de 47 cromosomas en las espermatogonias y 48 en las ovogonias , concluyendo un mecanismo de determinación del sexo XX/XO . [73] Painter en 1922 no estaba seguro de si el diploide de los humanos era 46 o 48, al principio favoreciendo 46, [74] pero revisó su opinión de 46 a 48, e insistió correctamente en que los humanos tenían un sistema XX/XY . [75] Teniendo en cuenta las técnicas de la época, estos resultados fueron notables.
Joe Hin Tjio, que trabajaba en el laboratorio de Albert Levan [76], descubrió que el recuento de cromosomas era 46 utilizando nuevas técnicas disponibles en ese momento:
Aplastar la preparación en el portaobjetos forzando a los cromosomas a estar en un solo plano.
Recortar una fotomicrografía y organizar el resultado en un cariograma indiscutible.
El trabajo se llevó a cabo en 1955 y se publicó en 1956. El cariotipo de los humanos incluye sólo 46 cromosomas. [77] [29] Los otros grandes simios tienen 48 cromosomas. Ahora se sabe que el cromosoma humano 2 es el resultado de una fusión de extremo a extremo de dos cromosomas ancestrales de simios. [78] [79]
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Enlaces externos
Medios relacionados con Cariotipos en Wikimedia Commons
Elaboración de un cariotipo, una actividad en línea del Centro de Aprendizaje de Ciencias Genéticas de la Universidad de Utah.
Actividad de cariotipo con historias de casos del Proyecto de Biología de la Universidad de Arizona.
Proyecto de cariotipo imprimible de Biology Corner, un sitio de recursos para profesores de biología y ciencias.
Técnicas de tinción y bandeo de cromosomas
Bjorn Biosystems para cariotipo y FISH Archivado el 12 de junio de 2019 en Wayback Machine