Hacia 1854, aun siendo cadete de esa misma institución, y después como teniente, combate inicialmente a los combatientes que sostenían el Plan de Ayutla, incluso en algún momento se menciona que apoya a su compañero y condiscípulo Miguel Miramón, cuando este emprende acciones armadas.Defendió al gobierno del presidente Benito Juárez al sofocar los disturbios en la capital cuando los militares rebeldes Miguel Negrete y Aureliano Rivera atrincheraron sus tropas en el edificio de La Ciudadela.Después junto a algunos generales como Ignacio Alatorre, Ignacio Mejía y Mariano Escobedo enfrentó a los últimos reductos porfiristas en Oaxaca, donde Félix Díaz Mori, hermano del jefe rebelde, fue brutalmente ejecutado.Santacilla Obregón, yerno del presidente Juárez lo elogió por su lealtad hacia el Benemérito y tras el triunfo sobre los escasos reductos rebeldes, las tropas bajo su mando entraron triunfantes a la capital.Al regresar a México fue nombrado por el mismo Porfirio Díaz, su antiguo enemigo, director del Colegio Militar, cargo que desempeñó hasta 1886.
