Habiendo participado en un intento de sabotaje conocido como el Levantamiento Velebit en 1932, se unió al Real Ejército Italiano y regresó a Croacia tras la Invasión a Yugoslavia en abril de 1941.
Luchó junto a los Ustachas hasta el final de la guerra, se reportó que logró evadir a los partisanos yugoslavos y fue visto en Bleiburg, un pequeño pueblo al sur de Austria.
Nada se sabe sobre que le pasó desde ese momento, solo existen varios rumores.
Fue a Kupres con 250 hombres bajo su mando, y organizó asesinatos en masa de Serbios locales.
Su meta era suprimir la rebelión y exterminar a la población serbia que quedase ahí.
Después, Boban comandó un grupo de Ustachas de Međugorje y Čitluk que tomaron como prisioneros a 20 civiles serbios, que fueron asesinados y enterrados en una zanja.