[2] Debido a que fue visto como un disidente, Lorković fue puesto bajo constante vigilancia policial.
En agosto, se opuso firmemente a una solicitud italiana para implementar la administración civil en la zona desmilitarizada del Estado Independiente de Croacia.
Los italianos contraatacaron la primavera siguiente acusando a Lorković de ser comunista.
En mayo de 1942, Lorković fue nombrado miembro honorario del Instituto Alemán para Estudios Fronterizos y Extranjeros.
En respuesta, el diplomático italiano Raffaele Casertano intentó que Lorković fuera destituido de su cargo.
Se reunió con el enviado del Ministerio de Relaciones Exteriores alemán Siegfried Kasche y Mladen Lorković, que representaba a Pavelić.
Himmler y Phleps prevalecieron en gran medida y crearon la división como lo consideraron oportuno, lo que provocó una grave insatisfacción entre los líderes del Estado Independiente de Croacia, particularmente con respecto a su composición étnica.
Tras su destitución, Lorković fue nombrado ministro en la presidencia del gobierno, donde era responsable de las relaciones con el ejército alemán, y se convirtió en un estrecho colaborador del general Edmund Glaise von Horstenau.
[10] Lorković abogó por un gobierno más fuerte y una mayor independencia en su actividad.
Lorković y algunos de sus asociados presentaron sus renuncias, que no fueron aceptadas.
Finalmente, Hitler dio permiso para que el Estado Independiente de Croacia se anexara el territorio "garantizando la independencia ilimitada de Croacia, incluida esta costa adriática croata".
En febrero de 1944, escribió un memorándum detallado en alemán que resumía la historia, la situación actual y los problemas fundamentales del Estado y sus Fuerzas Armadas, así como los problemas con el ejército alemán.
[10] Ese mes, lanzó una iniciativa para reanudar las negociaciones con el HSS, que llevó a cabo en su apartamento.
Allí, se reunió en secreto con Sinčić, August Košutić e Ivanko Farolfi.