En las elecciones nacionales de 1989, Pereyra se postuló a la Presidencia.
Si bien las elecciones fueron ganadas por Luis Alberto Lacalle, el Movimiento alcanzó su cenit electoral, superando al declinante Por la Patria.
Obtuvo tres senadores, once diputados, incluyendo dos mujeres: Matilde Rodríguez Larreta y Ana Lía Piñeyrúa, y varios intendentes, entre los que se destacaron Wilson Elso Goñi (posteriormente Ministro de Transporte en el gobierno de Lacalle) y Rodolfo Nin Novoa.
[6] El MNR impulsó en diciembre del 2010, la creación de "La Tercera Vía".
Laura Raffo consiguió el respaldo del histórico Movimiento Nacional de Rocha (MNR).
En épocas más recientes, el MNR apoyó a Jorge Larrañaga cuando en 1999 se proyectó a nivel nacional desde su Paysandú natal, y luego se alió con el Herrerismo y Aire Fresco para conformar el Sector TODOS y fortalecer la figura del actual presidente Luis Lacalle Pou.
Cossia, veterinario de profesión y Convencional Nacional del partido, fue diputado por Montevideo en las últimas dos legislaturas, desde donde lanzó iniciativas en materia de Salud, Bienestar y Protección Animal.