En 1876 resultó elegido primer vicepresidente del segundo gobierno constitucional de Prado, y nuevamente se repitió la historia: esta vez Prado marchó al sur al estallar la Guerra del Pacífico, quedando La Puerta en el mando interino en Lima, de mayo a noviembre de 1879.

Y ya bajo las órdenes del presidente Agustín Gamarra, participó en la campaña sobre la frontera boliviana en 1831.

[1]​ Permaneció estacionado en el Cuzco, donde fue jefe del Batallón del mismo nombre, hasta que fue elegido diputado por la provincia de Chumbivilcas, cargo que ejerció de 1845 a 1851.

[1]​ Iniciado el primer gobierno constitucional del presidente Mariano Ignacio Prado, fue elegido Presidente del Consejo de Ministros, y en tal condición, se encargó del mando interino, el 11 de octubre de 1867, cuando el presidente tuvo que marchar al sur para enfrentar la revolución que había estallado en Arequipa.

Se negó a la solicitud que le hicieron algunos políticos, encabezados por Francisco García Calderón, de convocar a elecciones para evitar la guerra civil, arguyendo que no podía ser desleal al presidente.

[8]​ Tras estallar la Guerra del Pacífico, el 17 de mayo de 1879, se encargó interinamente del gobierno, cuando el presidente Prado se trasladó a Arica para dirigir las operaciones militares en el sur.

No obstante, sus adversarios le criticaron por abandonar el teatro de las operaciones bélicas.

La Puerta se negó porque cuando Piérola lo destituyó, nadie había levantado una voz de protesta.