Fue Jefe Supremo del Perú por un breve periodo entre junio y septiembre de 1829.

También ocupó el poder provisionalmente en dos oportunidades en 1839, durante la presidencia interina de Gamarra, previa a su segundo gobierno constitucional.

En 1817 fue capturado por las tropas de San Martín y enviado prisionero a Buenos Aires.

Fue nombrado Vicepresidente y como tal ocupó interinamente el mando en dos ocasiones en que se ausentó Gamarra de la capital.

Emprendió entonces la retirada hacia Lima; pero fue detenido por un destacamento de patriotas, comandados por José Andrés Rázuri, y de vuelta a Trujillo, fue convencido por Torre Tagle para servir a la causa libertadora.

Participó luego en la marcha sobre Lima, el primer sitio del Callao y la campaña de Ica (1822); pero no se halló en el desastre de La Macacona por haber pasado a Lima en comisión.

No obstante, desobedeció las órdenes de fusilarlo y se limitó a desterrarlo.

A su solicitud fue transferido al ejército, cuando se inició la Guerra con la Gran Colombia.

Pero antes que entregarse de lleno a la defensa nacional, tenía otros planes.

La Fuente demoró su partida hacia la frontera con la Gran Colombia, alegando que se le debía someter a juicio de residencia.

Por ausencia del presidente Gamarra le tocó ejercer el mando en dos oportunidades: Su aparente contubernio con comerciantes extranjeros para introducir mercancías al Perú en perjuicio de los productores nacionales causó malestar en Lima, lo que aprovechó su adversaria, la famosa Mariscala (esposa del presidente Gamarra) para encabezar una asonada contra él.

Pero pronto fue acusado de conspirar contra el gobierno y fue deportado a Guayaquil.

Intentó luego volver, presentándose en la rada del Callao con ánimo de explicar su conducta.

Se encontraba en Chile cuando el gobierno de aquel país organizó la “Primera Expedición Restauradora” contra la Confederación Perú-Boliviana.

La Fuente retornó a Chile al igual que el resto de la expedición chileno-peruana.

La Fuente se enroló en esta nueva expedición, pero ya no como jefe de los peruanos pues como tal iba su viejo amigo Agustín Gamarra.

Éste fue ratificado en el gobierno, iniciando así su segundo período constitucional, y La Fuente siguió bajo su servicio.

Cuando Gamarra marchó sobre Bolivia, La Fuente quedó en Lima como General en Jefe y Comandante militar de los departamentos del Norte.

Estuvo al lado de Echenique durante la guerra civil que estalló en 1854.