El cambio más drástico lo sufrieron Lima, la Provincial del Callao, Loreto y Ucayali quienes fueron integrados juntos en la Región V, mientras que San Martín se unió a la Región II.
Finalmente, la exregión VIII se mantuvo intacta pero fue renombrada como Región VII.
Para la temporada 2005 se volvieron a introducir nuevos cambios en la conformación y denominación de las regiones.
U. Pichanaki A continuación se muestra una lista con los clubes que consiguieron por lo menos dos títulos regionales.
Se muestran en negrita los clubes campeones de la Copa Perú y los años en los que lo consiguieron.