Su madre Yekaterina Yakovlevna Schmidt (nacida von Wagner) era de ascendencia alemana.
Schmidt pasó su juventud en Berdyansk, donde su padre era gobernador de la ciudad (gradonachalnik) y jefe del puerto.
En 1893, Schmidt dejó Taganrog y se inscribió nuevamente en la Armada Imperial Rusa.
Schmidt era teniente comandante del destructor Número 253 de la Armada Imperial Rusa.
Trasladado al acorazado Tri Sviatitelia, su detención provocó intensas protestas, y las autoridades se vieron obligadas a liberarlo.
Al día siguiente, las fuerzas gubernamentales apoyadas por la artillería tomaron los cuarteles de la rebelión.