José María regresó a Buenos Aires en 1818 y decidió aprovechar su experiencia comercial, adquirida en el Brasil, para establecerse como comerciante.
Comenzó a participar en política durante la Anarquía del Año XX y fue reiteradamente electo legislador provincial.
Cuando las demás provincias presionaron para la reunión del Congreso, Roxas agravó un conflicto entre el diputado por la provincia de Corrientes y el caudillo Facundo Quiroga, y finalmente se retiró de Santa Fe, abortando la organización constitucional.
Renunció a continuar en ese cargo durante el gobierno de Juan Ramón Balcarce y fue elegido diputado en 1833.
Nuevamente fue ministro de hacienda en el segundo gobierno de Rosas el gobierno provincial, y llevó a cabo una administración especialmente prolija y con informes muy detallados, como le gustaba a Rosas.