[1] Regresó a su ciudad natal en 1859, en momentos en que recrudecía la Guerra entre la Confederación Argentina y el Estado de Buenos Aires.
En abril de 1865 al declararse la guerra del Paraguay se incorporó a la Armada Argentina y fue destinado como teniente en el vapor Guardia Nacional.
Fue luego designado como segundo comandante del vapor General Brown con el que combatió la rebelión jordanista en Paraná.
Fue luego destinado al vapor Rosetti y durante la Revolución de 1874 luchó contra la sublevada Paraná.
En 1877 fue puesto al mando del Pilcomayo pero tuvo escasa actividad y en el mes de junio pasó a reparaciones generales en Zarate.
Ya operando en el Río de la Plata por accidente el Bermejo embistió y hundió a la goleta mercante Andrea Doria.
En 1889 fue designado jefe de la División Torpedos y en 1890 pasó con similares funciones al Arsenal Zárate.
En 1898 Lowry fue nombrado vocal del Consejo de Guerra permanente para Jefes y Oficiales.