Aunque intentó ingresar en el Monasterio de Santa María del Parral, en Segovia, dos años después, no fue aceptado.Así que cuando se curó regresó a Sigüenza y estudió Teología sin obtener ningún grado más, quizá por no poderse costear los caros exámenes.El rey lo nombró bibliotecario del Monasterio de El Escorial, hacia donde marchó en 1575.El rey consiguió en 1590 que fijara allí definitivamente su residencia como miembro de la comunidad jerónima escurialense.En las filas altas situó libros prohibidos que venían de la Inquisición y los duplicados, por su menor uso.Fue sin embargo nombrado rector del Colegio de El Escorial dos veces (1594-1597 y 1600-1603).
