Sin embargo, por la extensión del último, se requirió, para su mejor administración y gobierno, su división en diversas provincias.

Durante su gobierno, no planteó reclamos territoriales e incluso nombró gobernadores en Jaén y en Maynas, reconociendo así la pertenencia de esta provincia al Perú.

[23]​ En todo el país, se organizaron actos indignantes contra Bolívar y Sucre.

No siendo la estación propicia para iniciar la demarcación, decidieron posponer los trabajos hasta abril de 1830.

Pasadas las lluvias, el gobierno peruano nombró a José Félix Castro y Modesto de la Vega como sus delegados, pero cuando llegaron a Tumbes se habían retirado los colombianos, sin que se les nombraran sustitutos.

Pero el empecinamiento de Mosquera, que no se conformaba con ganar «unas selvas en Jaén y Maynas», hizo imposible un arreglo definitivo.

El Perú reconoció al Ecuador como nación independiente, y recibió a su representante en Lima, Diego Noboa.

Se designó como capital la ciudad de Mocoa, abarcando los territorios bañados por los ríos Caquetá, Putumayo, Napo y Amazonas, desde la frontera con Ecuador hasta el Brasil.

José Manuel Tirado, por entonces canciller del Perú, sostuvo que, conforme al uti possidetis iure de 1810, esos territorios pertenecían a su país.

El ministro plenipotenciario peruano en Quito, Mariano José Sanz León, remitió su protesta.

[66]​ En 1887, el gobierno ecuatoriano pretendió renovar la cesión de territorios a una compañía inglesa.

[69]​[70]​ El 22 de diciembre de 1890, el Congreso colombiano expidió una ley por la cual se dio autorizaciones para crear misiones y servicio policial en las regiones bañadas por los ríos Caquetá, Putumayo, Amazonas y sus afluentes.

Ese mismo día, se firmó un modus vivendi en las zonas del Napo y Putumayo.

El compromiso arbitral duraría 10 años, siendo los asuntos litigiosos presentados al árbitro por convenciones especiales.

El tercer tratado fue de statu quo y modus vivendi en la zona en disputa.

Sin embargo, según parece, por la enorme influencia de la poderosa Casa Arana, su aprobación se vino retrasando.

La acusación señalaba que se estaban cometiendo horribles crímenes contra los indígenas del Putumayo: violaciones, torturas, mutilaciones y asesinatos.

Según la empresa, Hardenburg había intentado chantajearlos, indicando «que tenía en su poder documentos muy comprometedores para la Peruvian Amazon Co.».

Los brutales crímenes contra los indígenas, cometidos en esa zona tanto por peruanos como por colombianos, sacudieron la opinión pública en Gran Bretaña; más aún, cuando se descubrió que la sindicada por los terribles abusos poseía capital británico.

Carlos A. Valcárcel recibió las órdenes en noviembre de ese año, y el día 22, dispuso que se enjuiciara a los presuntos culpables.

Llegaría a ser senador de Loreto y opositor al Tratado Salomón-Lozano.

En una campaña de colonización hacia el Caquetá, la cual tenía por objetivo impedir que las tropas peruanas siguieran avanzado al territorio colombiano, el gobierno colombiano envió al General J. Isaías Gamboa a La Pedrera, en donde se encontraba instalada la aduana colombiana, con el General Gabriel Valencia como único refuerzo, sin contar con los recursos ni hombres suficientes para llevar a cabo su labor.

[101]​ El 10 de julio de 1911 se llevó a cabo un enfrentamiento entre colombianos y peruanos, el cual se desató cuando las tropas peruanas iniciaron la invasión del territorio colombiano que estaba a cargo del General Gamboa.

Esta estrategia funcionó los dos primeros días del enfrentamiento, logrando mantener a su batallón indemne, no obstante, era consciente y realista de la situación.

Enfermo como se encontraba en esos días, ordenó la retirada,[99]​ refugiándose con los pocos supervivientes en una localidad brasileña.

En el Perú, Leguía es todavía criticado por la firma de este tratado, considerado excesivamente entreguista.

[111]​ Tras la firma del tratado Salomón-Lozano, la población civil loretana tuvo un sentimiento dolido, contra la cesión de Leticia.

Al día siguiente, los peruanos se batieron en retirada, ante la imposibilidad de seguir con la lucha dejando pertrechos y armas.

Durante ocho horas, los peruanos resistieron el ataque hasta verse casi rodeados, donde varios soldados incluido un oficial el teniente garrido Lecca son hechos prisioneros del ejército de Colombia y se da la posterior ocupación colombiana del puerto de Güepí.

La delegación colombiana, por Roberto Urdaneta Arbeláez, Ministro de Relaciones Exteriores, Luis Cano Villegas y Guillermo Valencia Castillo.