Pero en 1830, al final de la guerra, la gran isla no era parte del nuevo estado griego.[3] Mehmet Ali garantizó la amnistía a los insurgentes cretenses durante la guerra de independencia si dejaban las armas y vivían en paz.Pero estas medidas pacificadoras no fueron unánimemente aceptadas: fueron rechazadas tanto por muchos musulmanes, que prefierían dejar la isla para establecerse en Asia Menor o en Alejandría, como por los cristianos que se niegan a deponer las armas y optan por exiliarse en Grecia.[6] Hasta entonces, los cristianos tenían que pagar jarach, doble capitulación a los no musulmanes de acuerdo con la ley Sharia, lo cual era un poderoso incentivo para que las poblaciones cristianas (ma'mīnīm) o judías (avdétis) de la isla se convirtieran al islam.[7] Durante las siguientes cuatro décadas, hasta la independencia en 1898, estallaron revueltas cada vez que se cuestionaba a Hatti-Houmayoun.El primero se oponía a cualquier movimiento revolucionario en la isla y les aconsejó que eligieran el camino pacífico de pedir reformas, prometiéndoles su probable apoyo.[11] En efecto, el gobierno griego desaprobaba enérgicamente cualquier movimiento insurreccional por el momento, creyendo que la situación política en Europa no era propicia para tal empresa.En cuanto a las escuelas, los hospitales y el transporte, admitió que se pueden hacer mejoras, pero solo de forma limitada.[13] Durante la insurrección, los barcos griegos forzaron el bloqueo otomano para abastecer la isla y evacuar a los heridos.En los tres años siguientes al conflicto se nombraron no menos de cinco gobernadores para sofocar la insurgencia.Las mujeres y los niños del pueblo de Agios Myron que se habían refugiado en una cueva fueron masacrados.Desembarcaron en Fodele donde fueron inmediatamente atacados por las fuerzas turcas y obligados a refugiarse en las montañas hacia Malevízi.Panos Koronaios nombró a Ioanis Dimakopoulos como comandante de la guarnición, asistido por el abad Gabriel Marinakis.A pesar de su vasta superioridad numérica, los turcos no pudieron tomar el monasterio el primer día.En una posición delicada, los esfakiotas se refugian en las calas con la esperanza de ser rescatados por los barcos griegos y europeos estacionados en la costa.Omer se unió a su ejército en Tymbaki, en la Massara, para organizar un nuevo ataque contra Sfakiá.[24] Las campañas de Omer muestran que el ejército turco es en gran medida capaz de competir y dominar a los rebeldes cretenses, pero que le resulta difícil imponer una hegemonía permanente y estable, especialmente en las zonas más remotas e inaccesibles.Formando una cadena que cubría toda la isla, estas torres debían asegurar un control militar permanente y una mejor vigilancia de los insurgentes.Creta permaneció en manos del Sultán, pero fue declarada una provincia privilegiada, gobernada según los estatutos especiales otorgados en 1867.Divididos en la persecución que se le daría al movimiento, la mayoría de ellos, como Konstantinos Sphakianakis, decidieron rendirse.Esta situación se ve agravada por la salida de 50 000 cretenses hacia el continente u otras islas griegas, principalmente mujeres y niños.[31] La administración otomana interviene directamente en la elección de los miembros y la representación étnica es muy favorable a los musulmanes.Por el contrario, la población musulmana busca su abolición y las autoridades encarcelan o exilian a quienes protestan contra las violaciones de la Ley Orgánica.Como resultado del levantamiento, la población se redujo debido a los combates, el exilio y la expulsión.Para mantener el orden, los sucesivos Gobernadores Generales son principalmente militares que dan poco crédito a las reformas.Pero el Estado griego no puede ayudar a Creta militar y económicamente, sobre todo porque Turquía está al mismo tiempo reuniendo tropas en la frontera norte del país.Además, los políticos griegos están divididos en cuanto al apoyo que se le dará a la isla.[12] Durante la revuelta, los barcos Hydra, Panhellenion, Arkadion, Creta y Enosis forzaron el bloqueo para llevar refugiados a Grecia.Formó un pequeño grupo de filocretas con otros tres franceses, un inglés, un americano, un italiano y un húngaro.En ese momento, los Estados Unidos estaban tratando de establecerse en el Mediterráneo y mostraron interés en Creta.
Mapa de 1861 que muestra la presencia de griegos (
en azul
) y turcos (
en rojo
) en Creta
Hatzimichalis Yannaris, jefe cretense de La Canée
El ejército otomano asalta el monasterio de Arkadi,
The Illustrated London News
, 1867.
Explosión del Monasterio de Arkadi, grabado de autor desconocido, 1867
La fortaleza de Aptera, reconstruida por los otomanos tras la revuelta de 1866-1969.