La prelatura territorial de Cafayate (en latín: Praelatura Territorialis Cafayatensis) es una circunscripción eclesiástica de la Iglesia católica en Argentina.
El papa Pablo VI lo nombró administrador apostólico, sin carácter episcopal, en la misma fecha de la erección de la prelatura territorial.
El segundo prelado elegido administrador diocesano fue el agustino Cipriano García Fernández, a quien el papa Juan Pablo II elevó después a la dignidad episcopal el 28 de mayo de 1991, designándolo obispo prelado de Cafayate.
Mariano Anastasio Moreno García recibió la ordenación episcopal y tomó posesión el 9 de marzo de 2008.
El 21 de abril de 2022 el papa Francisco nombró prelado al agustino recoleto Darío Rubén Quintana Muñíz.