A la edad de siete años,[1][2] hacia 1609, su padre lo llevó a la ciudad de Lisboa[1][2] en donde residía la abuela paterna[2] pero a su fallecimiento en 1628 entró al servicio de fray Cristóbal de Aresti[1] en la misma capital, en el momento en que se preparaba para viajar a la gobernación del Paraguay para ocupar el puesto de obispo.
[2] Pedro Gómez de Aguiar también fue regidor, alférez real y diputado del cabildo para representarlo en la gestión de los intereses comunales.
Por su iniciativa y bajo su dirección se procedió a reconstruir en 1652 el edificio del ayuntamiento y dio impulso a otras obras públicas.
Era nieta paterna del capitán portugués[8] Domingo Díaz Moreno y Pérez Cerqueyra[9] o simplemente Domingo Pérez[8] (n. ca.
1560) y de su esposo el mestizo hispano-inca Antón Martín de Don Benito y Yupanqui[8][9][11] (Lima, 1545 - Concepción del Bermejo, ca.
1443)[16] y su cónyuge Francisca González Mateos[16] (n. ca.