Sin embargo, los primeros registros del apellido se ubican en el principado de Asturias.
En algunos manuscritos nobiliarios (en los que las referencias históricas al rey Ordoño Bermúdez aparecen excesivamente escuetas) y en otros documentos, se asegura que su progenitor fue el rey Bermudo II.
Sin embargo, la atribución del origen del apellido al rey Bermudo no está clara, pues anterior a él aparece Nuno Ordóñez, infante de Galicia, como hijo del rey Ordoño I de Asturias y León (850-866) (hijo a su vez del rey Ramiro I n (842-850)) y padre del rey Alfonso III (866-910) y de los infantes: Por tanto, el que inicia dicho linaje sería el rey Ordoño I de Asturias y León.
El miembro más antiguo que se encuentra documentado en Peralta es del siglo XV: Fernando Ordóñez.
Entre esas expediciones llegó Hernán Sánchez Morillo, quien participó en la captura de Atahualpa en Cajamarca.
El apellido Ordóñez es frecuente en Ecuador ya que todos los descendientes directos eran propietarios de varias haciendas y tierras durante siglos, por lo cual los trabajadores del lugar adoptaban el apellido de los patrones.