Además, posee un Consejo General, que actúa como órgano asesor y de colaboración del Fiscal Nacional.
El Fiscal Nacional es el jefe superior del Ministerio Público y responsable de su funcionamiento.
El Fiscal Nacional dura ocho años en su cargo y no puede ser designado para el período siguiente.
Los Fiscales Regionales duran ocho años en el ejercicio de sus funciones y no pueden ser designados como tales por el período siguiente, lo que no obsta a que puedan ser nombrados en otro cargo del Ministerio Público.
Su actual Directiva electa para el período 2021-2023 está compuesta por su presidente, Francisco Bravo; vicepresidente Paolo Muñoz, secretaria general Alejandra Godoy y los Directores Marcelo Leiva, Erika Vargas y Marco Muñoz.
Los principios que informan la actuación del Ministerio Público son los siguientes:[cita requerida] El Fiscal Nacional es la máxima autoridad del Ministerio Público desde su creación en 1999, desde entonces tres funcionarios han ostentado esa función.