Iniciada la guerra del Brasil, Arenas sirvió en la escuadra republicana comandada por Guillermo Brown, resultando herido en el combate de Los Pozos en junio de 1826.

Considerado opositor al gobierno de Juan Manuel de Rosas, entre 1830 y 1835 revistó en la plana mayor inactiva hasta ser borrado del escalafón.

En 1847 regresó a Buenos Aires retirado de la acción política y militar.

Levantado el sitio, fue ascendido a coronel graduado por el gobierno del Estado de Buenos Aires.

Ese último año formó una compañía de zapadores.

El Hércules consiguió tomarlo pero otra bala cortó la cadena del timón, dejándolo sin gobierno, y los disparos hirieron a Bartolomé Cordero, pese a lo cual consiguió mantener el rumbo con la barca hasta salir del alcance de las baterías.