Afectado a la goleta Federación, recorrió las costas patagónicas y las Islas Malvinas.

Luchó en la artillería federal durante la Batalla de Pago Largo (1839), en Don Cristóbal y en Sauce Grande.

Durante la fase final del mismo, asignado a la escuadrilla del Uruguay leal al presidente Manuel Oribe, estuvo al mando de la goleta Presidente Oribe.

Ese año, Buenos Aires intentó nuevamente el cohecho y autorizó a pagar 5000 onzas de oro al que entregase al vapor Menay; Mariano Cordero rechazó airadamente la propuesta, del mismo modo que el comandante del buque, Julio Fonrouge.

En 1884 fue promovido a contralmirante, y en 1886, al grado de vicealmirante.

Pasó finalmente a retiro en 1896 como primer oficial almirante de la escuadra nacional.

[3]​ Tras su fallecimiento, el gobierno decretó honras fúnebres, y durante sus exequias despidieron sus restos Adolfo Justiniano Carranza y el ministro de Marina coronel Martín Rivadavia.