De 1986 a 1989 fue senadora por Segovia y portavoz adjunto del Grupo Popular en el Senado.
Fue portavoz adjunta a Rodrigo Rato del PP en el Congreso desde 1990 hasta 1996, año en que tras la victoria popular fue nombrada ministra.
En las elecciones celebradas en 1989 obtuvo el acta de Diputada por Segovia y ocupó el cargo de portavoz adjunto del Grupo Popular en el Congreso, cargo este último que abandonó en 1996 cuando José María Aznar la nombró Ministra de Agricultura, Pesca y Alimentación en el primer gobierno del Partido Popular tras ganar las elecciones generales celebradas ese año.
Durante 2006 los tribunales dictaminaron que Loyola de Palacio era inocente en dicho proceso.
El escándalo saltó a la palestra en 1999, año en que encabezaba la lista popular al Parlamento Europeo.
Su nombre sonó para ser sucesora de José María Aznar al frente del Partido Popular.
[5] También fue citada como posible candidata a lehendakari del Gobierno Vasco por el Partido Popular ya que, pese a haber nacido en Madrid, su familia era oriunda del País Vasco e, incluso, hablaba euskera.