En 1997 se traslada a España y al año siguiente es seleccionado para competir el Mundial como español en su ciudad natal argentina, Mar del Plata.
En el año 2000 y 2001, jugando junto a Hernán Auguste, se posicionan como una de las mejores parejas del mundo.
En 2001 logran alzarse con dos títulos en Sevilla, Altea, Sotogrande, Barcelona y Bilbao, terminando como la mejor pareja del año, por encima de Fernando Belasteguín / Pablo Martínez Semprún.
Ha sido la única pareja en la historia del pádel, en pasar 1 año y 9 meses invicta, ganando 23 torneos consecutivos.
Comenzaron a ganar inmediatamente en 2002, llevándose trofeos en Bilbao, San Sebastián, Altea, Torre Bellver, Puerto Santa María, Santander, Madrid, Barcelona, Euskadi, Sevilla, siendo los indiscutidos Nº1 del mundo de ese año, por encima de sus excompañeros Pablo Martínez Semprún / Hernán Auguste.
En dicho torneo, Juan Martín jugó con Paquito Navarro como pareja deportiva, logrando la victoria por 6-1 y 6-4 en su partido.
[3] Tres torneos después volvieron a alcanzar una final, en Bastad (Suecia), donde perdieron contra Fernando Belasteguín y Pablo Lima.
[4] Juani Mieres y Miguel Lamperti, sus rivales en semifinales, pasaron así a la final del torneo.