Tuvieron once hijos: Teresa, Juan Antonio, Luz, Amelia, Javier, Enrique, Begoña, Borja, Ramón, Ana María y Cosme.Javier Ybarra y Bergé continuó con esta labor por voluntad de su padre, incluso manteniéndola económicamente.Durante su mandato se preocupó por la expansión urbanística del municipio debido al fuerte crecimiento demográfico y la construcción de viviendas, sobre todo en Recaldeberri-Larrasquitu, Ocharcoaga, Churdínaga y Matico-Ciudad Jardín.Asimismo mejoró el abastecimiento de agua y los accesos a la ciudad.[3] El atentado recibió una condena unánime[4][5] tanto por los nuevos diputados vascos elegidos, como por Euskadiko Ezkerra y por el grupo de alcaldes de Vergara dirigido por José Luis Elkoro Unamuno.Javier Ybarra fue asesinado por ETA año y medio después de que quedase viudo.Yo estoy en las manos de Dios, perdono a los que me prendieron y pido perdón a quienes haya podido ofender y ofrezco mi vida por la conversión de los pecadores y por el encuentro de las almas con su Divino Redentor.
