Puede producirse mediante bacterias como producto de la degradación del aminoácido triptófano, así como su derivado, el escatol.

Esto ocurre en forma natural en las heces humanas, presentando el indol un intenso olor fecal.

Diversos pigmentos, por ejemplo el índigo y la púrpura de Tiro, son dímeros del indol.

Otros compuestos del indol incluyen las hormonas de los vegetales denominadas auxinas, un medicamento antiinflamatorio como la indometacina y el betabloqueante pindolol.

Luego, en 1866 Adolf von Baeyer redujo oxidol a indol usando polvo de zinc.