Seifert nació en Bernstadt auf dem Eigen, pero desde niño vivió en Bautzen, ya que su padre era allí funcionario judicial, y en dicha ciudad recibió toda su educación básica.
[1] En 1926 ingresó en la Universidad Técnica de Dresde para estudiar física y matemáticas.
En 1930 obtuvo el doctorado en Dresde con una tesis titulada Konstruktion dreidimensionaler geschlossener Räume ("Construcción de espacios tridimensionales cerrados"), que contiene el teorema de Seifert-van Kampen.
Dirigió las tesis de Albrecht Dold, Dieter Puppe y Horst Schubert, entre otros.
En 1992 fue nombrado miembro honorario de la Sociedad Matemática Alemana (Deutsche Mathematiker-Vereinigung).