Se casó en 1698 con el duque Federico IV de Holstein-Gottorp.

En su infancia y juventud, demostró gran interés por diversos campos del saber humano, lo que la colocó como una figura destacada dentro de la familia real.

El heredero, Carlos Federico, contaba con sólo dos años de edad, por lo que el Eduviges Sofía fungió como su tutora, pero el gobierno del ducado sería ocupado por el obispo de Lübeck, Cristián Augusto de Holstein-Gottorp.

Eduviges Sofía es conocida por la extensa correspondencia que mantuvo con su hermano, Carlos XII, mientras éste se hallaba en campañas militares, lo que evidencia una estrecha relación entre los hermanos.

Su hijo de ocho años fue encargado a su tío, Cristián Augusto, y ante la falta de hijos por parte del rey Carlos XII, fue nombrado heredero al trono, aunque finalmente el parlamento optaría por Ulrica Leonor, la hermana menor de Eduviges Sofía.