Durante las Guerras napoleónicas, Maucune lideró el 39.º en Elchingen, bajo el mariscal Michel Ney en la campaña de 1805, y en Jena, Magdeburgo, Soldau y Eylau en la campaña de 1806 – 1807.
En mayo de 1811, el ejército se reorganizó y Maucune fue ascendido para liderar una división.
Esto inició un período de notable mala suerte.
La división se perdió la batalla de Vitoria, pero ayudó a combatir la persecución aliada en Tolosa.
Después de estas derrotas, el mariscal Soult lo reemplazó por Jean François Leval.