Administrativamente, está incorporada como ciudad de importancia regional.
Las raíces de la ciudad se remontan a la Edad Media.
Este nombre puede explicarse por el hecho de que el duque lituano Algirdas capturó Vínnytsia y las tierras circundantes en el siglo XIV, y luego, se las regaló a sus sobrinos.
[8] Vínnytsia ha sido un importante centro comercial y político desde el siglo XIV, cuando Teodoro Koriátovich, sobrino del duque lituano Algirdas, construyó una fortaleza (1363) contra los asaltantes tártaros a orillas del Bug Meridional.
El asentamiento original fue construido y poblado por Aleksánder Jélec, un hetman a las órdenes del príncipe lituano Švitrigaila.
Aleksánder Jélec construyó el fuerte, que después comandó como starósta.
En 1566, pasó a formar parte del voivodato de Brátslav.
En 1943, durante la ocupación alemana de Ucrania, se desenterraron 9432 cuerpos en Vínnitsa y los alrededores.
Previamente, Vínnytsia había sido declarada «libre de judíos».