Su familia se mudó a los Estados Unidos cuando Tom tenía cinco años.Araya consiguió un trabajo en 1980 como inhaloterapeuta, su salario lo utilizó para cofinanciar la producción del primer álbum de Slayer, Show No Mercy.Su primera contribución lírica fue en el disco Hell Awaits (1985), en la canción «At Dawn They Sleep».[2] En 1991, en la gira "Clash of Titans" con Megadeth, Anthrax, Suicidal Tendencies y Alice in Chains, Dave Mustaine, el controvertido líder de Megadeth, le dijo a Araya: «Me gusta cuando me chupas la polla».[3] Los insultos entre ambas bandas hicieron que las relaciones entre Megadeth y Slayer se debilitaran hasta la actualidad, aunque anteriormente, Mustaine había insultado a Kerry King después de que este decidiese concentrarse en Slayer en lugar de en Megadeth, donde permaneció como miembro durante un mes.Durante esta gira, Araya se hizo amigo de Jerry Cantrell, guitarrista de Alice in Chains, lo que provocó que Araya colaborase en la canción «Iron Gland» del álbum Dirt: «Sólo grité en ella.[2] Araya escribió la letra de «Eyes of the Insane» del disco Christ Illusion, que ganó un premio Grammy en 2006.Araya declaró: «En puntos de su misión en Irak, los militares necesitan ayuda, y tienden a rechazarla.