La lista de instrumentos que ha tocado con su banda es amplia e incluye flauta, guitarras acústicas y eléctricas, bajo, saxofón, órgano Hammond, batería, teclados, trombón, gaita escocesa, gran variedad de whistles (flautines) y violín.[4] En 1963, Anderson formó The Blades con sus compañeros de estudios Barriemore Barlow (batería), John Evan (teclados), Jeffrey Hammond (bajo) y Michael Stephens (guitarra).Allí conoció al batería Clive Bunker y el guitarrista Mick Abrahams, procedentes de McGregor's Engine.En su dilatada carrera musical iría añadiendo nuevos instrumentos tales como la mandolina, el saxofón y los teclados, entre otros.[3][6] Anderson ya deseaba comenzar una carrera en solitario en 1980, cuando Jethro Tull iba a tomarse un descanso tras la muerte de John Glascock.Escribió el álbum A como un disco en solitario, pero la participación de Martin Barre y Dave Pegg llevó a que el disco fuera lanzado bajo el nombre de Jethro Tull, ocasionando que la vieja banda se dividiera.En 1995 lanzó su segundo álbum en solitario, Divinities: Twelve Dances with God, una obra instrumental compuesta por doce piezas para flauta.Anderson lanzó otros dos álbumes solistas basados en canciones, The Secret Language of Birds en 2000 y Rupi's Dance en 2003.Dos años después publicó un nuevo disco como solista, titulado Homo Erraticus, en mayo de 2014.También en 2020 declaró en una entrevista que padece una enfermedad respiratorio incurable llamada EPOC, adquirida según el propio músico por su constante exposición a las máquinas de humo usadas en los conciertos.Más tarde se sorprendería al ver imágenes de varios iconos divinos tocando la flauta sobre una pierna como Krishna y Kokopelli.[2] No conformándose sólo con la flauta también toca guitarra, bajo, bouzouki, balalaika, saxofón, armónica y una gran variedad de whistles.[14][15] El cantante ha sobrevivido a una peligrosa trombosis venosa profunda, sufrida tras un vuelo en avión en precarias condiciones de espacio y ha realizado frecuentes declaraciones para que se tome conciencia sobre los peligros para la salud que puede provocar la sobreexplotación comercial de las líneas aéreas.