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BRCA2

BRCA2 y BRCA2 ( / ˌbrækəˈtuː / [ 5 ] ) son genes humanosy sus productos proteicos , respectivamente . El símbolo oficial (BRCA2, cursiva para el gen, no cursiva para la proteína) y el nombre oficial (originalmente cáncer de mama 2 ; actualmente BRCA2 , reparación de ADN asociada ) son mantenidos por el Comité de Nomenclatura Genética HUGO . Un símbolo alternativo, FANCD1 , reconoce su asociación con elcomplejo proteico FANC . Los ortólogos , llamados Brca2 y Brca2, son comunes en otrasespecies de vertebrados . [6] [7] BRCA2 es un gen supresor de tumores humano [8] [9] (específicamente, un gen cuidador ), que se encuentra en todos los humanos; su proteína , también llamada por el sinónimo proteína de susceptibilidad al cáncer de mama tipo 2 , es responsable de reparar el ADN. [10]

BRCA2 y BRCA1 se expresan normalmente en las células de la mama y otros tejidos, donde ayudan a reparar el ADN dañado o a destruir células si el ADN no puede repararse. Están involucrados en la reparación del daño cromosómico con un papel importante en la reparación sin errores de las roturas de doble cadena de ADN. [11] [12] Si BRCA1 o BRCA2 se dañan por una mutación BRCA , el ADN dañado no se repara correctamente, y esto aumenta el riesgo de cáncer de mama . [13] [14] BRCA1 y BRCA2 se han descrito como "genes de susceptibilidad al cáncer de mama" y "proteínas de susceptibilidad al cáncer de mama". El alelo predominante tiene una función supresora de tumores normal, mientras que las mutaciones de alta penetrancia en estos genes causan una pérdida de la función supresora de tumores, que se correlaciona con un mayor riesgo de cáncer de mama. [15]

El gen BRCA2 se encuentra en el brazo largo (q) del cromosoma 13 en la posición 12.3 (13q12.3). [16] El gen BRCA2 de referencia humano contiene 27 exones y el ADNc tiene 10.254 pares de bases [17] que codifican una proteína de 3418 aminoácidos. [18] [19]

Función

Reparación recombinatoria de daños en la doble cadena del ADN: algunos pasos clave. ATM (ATM) es una proteína quinasa que se recluta y activa por roturas de la doble cadena del ADN . Los daños en la doble cadena del ADN también activan el complejo central de anemia de Fanconi (FANCA/B/C/E/F/G/L/M). [20] El complejo central FA monoubiquitina los objetivos posteriores FANCD2 y FANCI. [21] ATM activa (fosforila) CHEK2 y FANCD2 [22] CHEK2 fosforila BRCA1. [23] Complejos FANCD2 ubiquinados con BRCA1 y RAD51 . [24] La proteína PALB2 actúa como un centro, [25] uniendo BRCA1, BRCA2 y RAD51 en el sitio de una rotura de doble cadena de ADN, y también se une a RAD51C, un miembro del complejo parálogo RAD51 RAD51B - RAD51C - RAD51D - XRCC2 (BCDX2). El complejo BCDX2 es responsable del reclutamiento o estabilización de RAD51 en los sitios dañados. [26] RAD51 juega un papel importante en la reparación recombinatoria homóloga del ADN durante la reparación de la rotura de doble cadena. En este proceso, se produce un intercambio de cadenas de ADN dependiente de ATP en el que una sola cadena invade cadenas con pares de bases de moléculas de ADN homólogas. RAD51 está involucrado en la búsqueda de homología y en las etapas de apareamiento de cadenas del proceso.

Aunque las estructuras de los genes BRCA1 y BRCA2 son muy diferentes, al menos algunas funciones están interrelacionadas. Las proteínas producidas por ambos genes son esenciales para reparar el ADN dañado (ver Figura de los pasos de reparación recombinacional). BRCA2 se une al ADN de cadena sencilla e interactúa directamente con la recombinasa RAD51 para estimular [27] y mantener [28] la invasión de la cadena, un paso vital de la recombinación homóloga . La localización de RAD51 en la rotura de doble cadena del ADN requiere la formación del complejo BRCA1-PALB2-BRCA2. PALB2 (socio y localizador de BRCA2) [29] puede funcionar sinérgicamente con una quimera BRCA2 (denominada piccolo o piBRCA2) para promover aún más la invasión de la cadena. [30] Estas roturas pueden ser causadas por radiación natural y médica u otras exposiciones ambientales, pero también ocurren cuando los cromosomas intercambian material genético durante un tipo especial de división celular que crea espermatozoides y óvulos ( meiosis ). Durante la reparación de los enlaces cruzados del ADN también se generan roturas de doble cadena. Al reparar el ADN, estas proteínas desempeñan un papel en el mantenimiento de la estabilidad del genoma humano y evitan reordenamientos genéticos peligrosos que pueden provocar cánceres hematológicos y de otros tipos.

Se ha demostrado que BRCA2 tiene un papel crucial en la protección contra la degradación nucleolítica dependiente de MRE11 de las horquillas invertidas que se forman durante el estancamiento de la horquilla de replicación del ADN (causado por obstáculos como mutaciones, agentes intercalantes, etc.). [31]

Al igual que BRCA1, BRCA2 probablemente regula la actividad de otros genes y juega un papel crítico en el desarrollo del embrión.

Importancia clínica

Riesgo absoluto de cánceres en la mutación BRCA1 o BRCA2. [32]

Ciertas variaciones del gen BRCA2 aumentan los riesgos de cáncer de mama como parte de un síndrome hereditario de cáncer de mama y ovario . Los investigadores han identificado cientos de mutaciones en el gen BRCA2 , muchas de las cuales provocan un mayor riesgo de cáncer. Las mutaciones BRCA2 suelen ser inserciones o deleciones de una pequeña cantidad de pares de bases de ADN en el gen. Como resultado de estas mutaciones, el producto proteico del gen BRCA2 es anormal y no funciona correctamente. Los investigadores creen que la proteína BRCA2 defectuosa no puede reparar el daño del ADN que se produce en todo el genoma. Como resultado, hay un aumento de las mutaciones debido a la síntesis de translesiones propensa a errores más allá del daño del ADN no reparado, y algunas de estas mutaciones pueden hacer que las células se dividan de forma descontrolada y formen un tumor.

Las personas que tienen dos copias mutadas del gen BRCA2 tienen un tipo de anemia de Fanconi . Esta afección es causada por niveles extremadamente reducidos de la proteína BRCA2 en las células, lo que permite la acumulación de ADN dañado. Los pacientes con anemia de Fanconi son propensos a varios tipos de leucemia (un tipo de cáncer de células sanguíneas); tumores sólidos, particularmente de cabeza, cuello, piel y órganos reproductivos; y supresión de la médula ósea (producción reducida de células sanguíneas que conduce a anemia ). Las mujeres que han heredado un gen BRCA1 o BRCA2 defectuoso tienen riesgos de cáncer de mama y ovario que son tan altos y parecen tan selectivos que muchas portadoras de mutaciones eligen someterse a cirugía profiláctica . Se ha conjeturado mucho para explicar esta especificidad tisular aparentemente sorprendente. Los principales determinantes de dónde ocurren los cánceres hereditarios asociados con BRCA1 y BRCA2 están relacionados con la especificidad tisular del patógeno del cáncer, el agente que causa la inflamación crónica o el carcinógeno. El tejido diana puede tener receptores para el patógeno, quedar expuesto selectivamente a carcinógenos y un proceso infeccioso. Un déficit genómico innato altera las respuestas normales y exacerba la susceptibilidad a la enfermedad en los órganos diana. Esta teoría también se ajusta a los datos de varios supresores tumorales más allá de BRCA1 o BRCA2 . Una ventaja importante de este modelo es que sugiere que existen algunas opciones además de la cirugía profiláctica. [33]

Además del cáncer de mama en hombres y mujeres, las mutaciones en BRCA2 también provocan un mayor riesgo de cáncer de ovario , de trompas de Falopio , de próstata y de páncreas . En algunos estudios, las mutaciones en la parte central del gen se han asociado con un mayor riesgo de cáncer de ovario y un menor riesgo de cáncer de próstata que las mutaciones en otras partes del gen. También se han observado otros tipos de cáncer [ ¿cuáles? ] en ciertas familias con mutaciones en BRCA2 . [ cita requerida ]

En general, las mutaciones genéticas fuertemente heredadas (incluidas las mutaciones en BRCA2 ) representan solo el 5-10% de los casos de cáncer de mama; el riesgo específico de contraer cáncer de mama u otro cáncer para cualquier persona portadora de una mutación BRCA2 depende de muchos factores. [34]

Historia

El gen BRCA2 fue descubierto en 1994. [35] [16] [36] En 1996, Kenneth Offit y su grupo de investigación en el Memorial Sloan Kettering Cancer Center identificaron con éxito la mutación más común en el gen asociado con el cáncer de mama y de ovario entre individuos de ascendencia judía asquenazí . [37] [38] [39] [40]

El gen fue clonado por primera vez por científicos de Myriad Genetics , Endo Recherche, Inc., HSC Research & Development Limited Partnership y la Universidad de Pensilvania . [41]

Los métodos para diagnosticar la probabilidad de que un paciente con mutaciones en BRCA1 y BRCA2 desarrolle cáncer estaban cubiertos por patentes propiedad de o controladas por Myriad Genetics . [42] [43] El modelo de negocios de Myriad de ofrecer exclusivamente la prueba de diagnóstico condujo desde los comienzos de Myriad como una startup en 1994 a su conversión en una empresa que cotiza en bolsa con 1200 empleados y alrededor de $500 millones en ingresos anuales en 2012; [44] también generó controversia sobre los altos precios de las pruebas y la falta de disponibilidad de segundas opiniones de otros laboratorios de diagnóstico, lo que a su vez condujo a la histórica demanda de la Asociación de Patología Molecular contra Myriad Genetics . [45]

Mutaciones de la línea germinal y efecto fundador

Todas las mutaciones de la línea germinal BRCA2 identificadas hasta la fecha han sido heredadas, lo que sugiere la posibilidad de un gran efecto "fundador" en el que una determinada mutación es común a un grupo de población bien definido y teóricamente puede rastrearse hasta un ancestro común. Dada la complejidad del cribado de mutaciones para BRCA2, estas mutaciones comunes pueden simplificar los métodos necesarios para el cribado de mutaciones en ciertas poblaciones. El análisis de mutaciones que ocurren con alta frecuencia también permite el estudio de su expresión clínica. [46] Un ejemplo sorprendente de una mutación fundadora se encuentra en Islandia, donde una única mutación BRCA2 (999del5) explica prácticamente todas las familias con cáncer de mama/ovario. [47] [48] Esta mutación de cambio de marco conduce a un producto proteico altamente truncado. En un gran estudio que examinó a cientos de individuos con cáncer y de control, esta mutación 999del5 se encontró en el 0,6% de la población general. Cabe destacar que, si bien el 72 % de las pacientes que resultaron ser portadoras tenían antecedentes familiares moderados o fuertes de cáncer de mama, el 28 % tenía pocos o ningún antecedente familiar de la enfermedad. Esto sugiere firmemente la presencia de genes modificadores que afectan la expresión fenotípica de esta mutación, o posiblemente la interacción de la mutación BRCA2 con factores ambientales. En la siguiente tabla se ofrecen ejemplos adicionales de mutaciones fundadoras en BRCA2.

Mitosis

En la planta Arabidopsis thaliana , la pérdida del homólogo de BRCA2, AtBRCA2, causa graves defectos tanto en la meiosis masculina como en el desarrollo del gametocito femenino . [65] La proteína AtBRCA2 es necesaria para la localización adecuada de la proteína del complejo sinaptonémico AtZYP1 y las recombinasas AtRAD51 y AtDMC1. Además, AtBRCA2 es necesaria para una sinapsis meiótica adecuada. Por lo tanto, es probable que AtBRCA2 sea importante para la recombinación meiótica. Parece que AtBRCA2 actúa durante la meiosis para controlar los pasos de invasión de cadena sencilla mediados por AtRAD51 y AtDMC1 que ocurren durante la reparación recombinacional homóloga meiótica de los daños en el ADN. [65]

Los homólogos de BRCA2 también son esenciales para la meiosis en el hongo Ustilago maydis , [66] el gusano Caenorhabditis elegans , [67] [68] y la mosca de la fruta Drosophila melanogaster . [69]

Los ratones que producen versiones truncadas de BRCA2 son viables pero estériles. [70] Las ratas mutantes BRCA2 tienen un fenotipo de inhibición del crecimiento y esterilidad en ambos sexos. [71] La aspermatogénesis en estas ratas mutantes se debe a una falla de la sinapsis de los cromosomas homólogos durante la meiosis.

Secuencias repetidas de BRC

La DMC1 (recombinasa meiótica del ADN 1) es unhomólogo específico de la meiosis de RAD51 que media el intercambio de hebras durante la reparación recombinacional homóloga . La DMC1 promueve la formación de productos de invasión de la hebra de ADN (moléculas de unión) entre moléculas de ADN homólogas. La DMC1 humana interactúa directamente con cada una de una serie de secuencias repetidas en la proteína BRCA2 (llamadas repeticiones BRC) que estimulan la formación de moléculas de unión por parte de la DMC1. [72] Las repeticiones BRC se ajustan a un motivo que consiste en una secuencia de aproximadamente 35 aminoácidos altamente conservados que están presentes al menos una vez en todas las proteínas similares a BRCA2. Las repeticiones BRC de BRCA2 estimulan la formación de moléculas de unión al promover la interacción del ADN monocatenario (ssDNA) con la DMC1. [72] El ssDNA complejado con la DMC1 puede emparejarse con el ssDNA homólogo de otro cromosoma durante la etapa de sinopsis de la meiosis para formar una molécula de unión, un paso central en la recombinación homóloga . Por lo tanto, las secuencias repetidas BRC de BRCA2 parecen desempeñar un papel clave en la reparación recombinacional de los daños en el ADN durante la recombinación meiótica.

En general, parece que la recombinación homóloga durante la meiosis funciona para reparar los daños en el ADN, [ cita requerida ] y que BRCA2 juega un papel clave en el desempeño de esta función.

Neurogénesis

El gen BRCA2 es necesario en el ratón para la neurogénesis y la supresión del meduloblastoma . [73] La pérdida del gen BRCA2 afecta profundamente a la neurogénesis, en particular durante el desarrollo neuronal embrionario y posnatal. Estos defectos neurológicos surgen del daño del ADN. [73]

Control epigenético

Las alteraciones epigenéticas en la expresión de BRCA2 (que causan sobreexpresión o subexpresión) son muy frecuentes en cánceres esporádicos (ver la tabla a continuación), mientras que las mutaciones en BRCA2 se encuentran raramente. [74] [75] [76]

En el cáncer de pulmón de células no pequeñas, el BRCA2 se reprime epigenéticamente por la hipermetilación del promotor. [77] En este caso, la hipermetilación del promotor está significativamente asociada con una baja expresión de ARNm y una baja expresión de proteína, pero no con la pérdida de heterocigosidad del gen.

En el cáncer de ovario esporádico, se encontró un efecto opuesto. Las regiones promotora y 5'-UTR de BRCA2 tienen relativamente pocos o ningún dinucleótido CpG metilado en el ADN tumoral en comparación con el ADN no tumoral, y se encontró una correlación significativa entre la hipometilación y una sobreexpresión de BRCA2 de >3 veces. [78] Esto indica que la hipometilación de las regiones promotora y 5'-UTR de BRCA2 conduce a la sobreexpresión del ARNm de BRCA2.

Un informe indicó cierto control epigenético de la expresión de BRCA2 por los microARN miR-146a y miR-148a. [79]

Expresión de BRCA2 en el cáncer

En eucariotas , la proteína BRCA2 tiene un papel importante en la reparación recombinacional homóloga. En ratones y humanos, BRCA2 media principalmente el ensamblaje ordenado de RAD51 en ADN monocatenario (ss), la forma que es activa para el apareamiento homólogo y la invasión de hebras. [80] BRCA2 también redirige RAD51 del ADN bicatenario y previene la disociación del ssDNA. [80] Además, los cuatro parálogos de RAD51 , que consisten en RAD51B ( RAD51L1 ), RAD51C (RAD51L2), RAD51D ( RAD51L3 ), XRCC2 forman un complejo llamado complejo BCDX2 (ver Figura: Reparación recombinacional de ADN). Este complejo participa en el reclutamiento o estabilización de RAD51 en sitios dañados. [26] El complejo BCDX2 parece actuar facilitando el ensamblaje o la estabilidad del filamento de nucleoproteína RAD51 . RAD51 cataliza la transferencia de cadena entre una secuencia rota y su homólogo no dañado para permitir la resíntesis de la región dañada (ver modelos de recombinación homóloga ).

Algunos estudios sobre cánceres informan de una sobreexpresión de BRCA2 , mientras que otros estudios informan de una subexpresión de BRCA2 . Al menos dos informes encontraron sobreexpresión en algunos tumores mamarios esporádicos y subexpresión en otros tumores mamarios esporádicos. [81] [82] (véase la Tabla).

Muchos cánceres tienen deficiencias epigenéticas en varios genes de reparación del ADN (ver Frecuencias de epimutaciones en genes de reparación del ADN en cánceres ). Estas deficiencias de reparación probablemente causan un aumento de los daños no reparados del ADN. La sobreexpresión de BRCA2 observada en muchos cánceres puede reflejar una sobreexpresión compensatoria de BRCA2 y una mayor reparación recombinatoria homóloga para lidiar al menos parcialmente con tales daños excesivos del ADN. Egawa et al. [83] sugieren que el aumento de la expresión de BRCA2 puede explicarse por la inestabilidad genómica que se observa con frecuencia en los cánceres, que induce la expresión del ARNm de BRCA2 debido a una mayor necesidad de BRCA2 para la reparación del ADN.

La subexpresión de BRCA2 conduciría a un aumento de los daños no reparados en el ADN. Los errores de replicación más allá de estos daños (ver síntesis translesional ) conducirían a un aumento de las mutaciones y el cáncer.

Interacciones

Se ha demostrado que BRCA2 interactúa con

Arquitectura de dominio

BRCA2 contiene una cantidad de 39 repeticiones de aminoácidos que son fundamentales para la unión a RAD51 (una proteína clave en la reparación recombinatoria del ADN) y la resistencia al tratamiento con metilmetanosulfonato. [102] [109] [110] [118]

El dominio helicoidal BRCA2 adopta una estructura helicoidal , que consiste en un núcleo de cuatro hélices (alfa 1, alfa 8, alfa 9, alfa 10) y dos horquillas beta sucesivas (beta 1 a beta 4). Un segmento de aproximadamente 50 aminoácidos que contiene cuatro hélices cortas (alfa 2 a alfa 4), serpentea alrededor de la superficie de la estructura central . En BRCA2, las hélices alfa 9 y alfa 10 se empaquetan con el dominio OB1 de BRCA2 a través de contactos de van der Waals que involucran residuos hidrofóbicos y aromáticos, y también a través de enlaces de hidrógeno de cadena lateral y de cadena principal . Este dominio se une a la proteína DSS1 de 70 aminoácidos (eliminada en el síndrome de mano hendida/pie hendido), que originalmente se identificó como uno de los tres genes que se asignan a un locus de 1,5 Mb eliminado en un síndrome de malformación del desarrollo hereditario. [116]

El dominio BRCA OB1 asume un pliegue OB , que consiste en una lámina beta de cinco cadenas altamente curvada que se cierra sobre sí misma para formar un barril beta . OB1 tiene un surco poco profundo formado por una cara de la lámina curva y está demarcado por dos bucles, uno entre beta 1 y beta 2 y otro entre beta 4 y beta 5, lo que permite una unión débil del ADN monocatenario . El dominio también se une a la proteína DSS1 de 70 aminoácidos (eliminada en el síndrome de mano hendida/pie hendido). [116]

El dominio OB3 de BRCA asume un pliegue OB , que consiste en una lámina beta de cinco cadenas altamente curvada que se cierra sobre sí misma para formar un barril beta . OB3 tiene un surco pronunciado formado por una cara de la lámina curva y está demarcado por dos bucles, uno entre beta 1 y beta 2 y otro entre beta 4 y beta 5, lo que permite una fuerte unión del ssDNA . [116]

El dominio Tower adopta una estructura secundaria que consiste en un par de hélices alfa largas y antiparalelas (el tallo) que sostienen un haz de tres hélices (3HB) en su extremo. El 3HB contiene un motivo hélice-giro-hélice y es similar a los dominios de unión al ADN de las recombinasas específicas del sitio bacterianas y de los factores de transcripción eucariotas Myb y homeodominio . El dominio Tower tiene un papel importante en la función supresora de tumores de BRCA2 y es esencial para la unión apropiada de BRCA2 al ADN. [116] Los estudios han demostrado que la conformación de este dominio Tower está controlada alostéricamente por una pequeña proteína "DSS1", que interactúa con los dominios helicoidales OB1 y OB2 de BRCA2. [119]

Patentes, cumplimiento, litigios y controversias

En 1994, la Universidad de Utah, el Instituto Nacional de Ciencias de la Salud Ambiental (NIEHS) y Myriad Genetics presentaron una solicitud de patente para el gen BRCA1 aislado y las mutaciones que promueven el cáncer, así como para los métodos para diagnosticar la probabilidad de contraer cáncer de mama; [42] durante el año siguiente, Myriad, en colaboración con otros investigadores, aisló y secuenció el gen BRCA2 e identificó las mutaciones relevantes, y Myriad y otras instituciones presentaron la primera patente de BRCA2 en los EE. UU. en 1995. [41] Myriad es el licenciatario exclusivo de estas patentes y las ha hecho cumplir en los EE. UU. contra los laboratorios de diagnóstico clínico. [45] Este modelo de negocio llevó a Myriad de ser una startup en 1994 a ser una empresa que cotiza en bolsa con 1200 empleados y alrededor de $500 millones en ingresos anuales en 2012; [44] También generó controversia sobre los altos precios y la imposibilidad de obtener segundas opiniones de otros laboratorios de diagnóstico, lo que a su vez condujo a la histórica demanda de la Asociación de Patología Molecular contra Myriad Genetics . [45] [120] Las patentes comienzan a expirar en 2014.

Peter Meldrum, director ejecutivo de Myriad Genetics, ha reconocido que Myriad tiene "otras ventajas competitivas que pueden hacer innecesaria dicha aplicación [de patentes]" en Europa. [121]

Las decisiones legales en torno a las patentes de BRCA1 y BRCA2 afectarán al campo de las pruebas genéticas en general. [122] En junio de 2013, en Association for Molecular Pathology v. Myriad Genetics (No. 12-398), la Corte Suprema de los Estados Unidos dictaminó por unanimidad que "un segmento de ADN que se produce de forma natural es un producto de la naturaleza y no es elegible para una patente simplemente porque ha sido aislado", invalidando las patentes de Myriad sobre los genes BRCA1 y BRCA2. Sin embargo, la Corte también sostuvo que la manipulación de un gen para crear algo que no se encuentra en la naturaleza aún podría ser elegible para la protección de patentes. [123] El Tribunal Federal de Australia llegó a la conclusión opuesta, confirmando la validez de una patente australiana de Myriad Genetics sobre el gen BRCA1 en febrero de 2013, [124] pero esta decisión está siendo apelada y la apelación incluirá la consideración del fallo de la Corte Suprema de los Estados Unidos. [125]

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