Aunque tomó cariño por los terrícolas con los que trabajó (como Liz Shaw y Jo Grant), aprovechaba cualquier oportunidad de volver a las estrellas con un entusiasmo juvenil (como puede verse por su actitud frívola en The Mutants) Si este Doctor tenía un aire ligeramente paternalista y autoritario, también era rápido en criticar a la autoridad, teniendo muy poca paciencia con los burócratas autocomplacientes, los ministros parroquianos, los militares pelmazos y los papeleos en general.
Su valentía podía convertirse fácilmente en indignación enojosa; no sorprende que una muletilla suya fuera, "¡Ahora escúchame a mí!"
En general, esta encarnación del Doctor era más atrevida físicamente que las dos anteriores, y fue el primero en enfrentarse a los enemigos por la fuerza si estaba acorralado (sus dos encarnaciones anteriores casi siempre intentaban esquivar, huir o negociar antes que atacar).
Solo usaba sus habilidades en la lucha si no tenía otra alternativa, e incluso entonces generalmente desarmaba a sus oponentes en lugar de dejarlos inconscientes.
Quizás por el tiempo que pasó en la Tierra, o quizá simplemente por su tendencia pacifista y autoritativa, el Tercer Doctor era un experimentado diplomático (reactivando los diálogos en The Curse of Peladon, por ejemplo) y lingüista, y también tenía cierta maña para los disfraces; todo esto, combinado con su formidable experiencia galáctica, solía permitir al Tercer Doctor tomar un papel central en los eventos en los que se encontraba.
Esto fue porque Terrance Dicks le aconsejó hacer de sí mismo con el Tercer Doctor: ciertamente, que "interpretara a Jon Pertwee".
Pertwee recordó preguntarse a sí mismo, tras este consejo, "¿Y ahora quién diablos es ese?"
La novela Christmas on a Rational Planet de Virgin New Adventures explicó la marca como un símbolo de los Señores del Tiempo que identificaba a un exiliado, y fue eliminada una vez que el exilio del Doctor fue conmutado.
Sin embargo, según avanzaba el tiempo, iba encontrando razones para abandonar la Tierra, normalmente enviado a misiones por los Señores del Tiempo.
Finalmente, tras derrotar al renegado Omega en The Three Doctors, los Señores del Tiempo le dieron la libertad completa en agradecimiento por salvar Gallifrey.
Durante el episodio The Almost People, un clon del Undécimo Doctor pronuncia la frase mientras intenta adaptarse a los recuerdos de todas las regeneraciones.
En la última temporada del Tercer Doctor se creó una nueva secuencia de títulos, diseñada por Bernard Lodge.
La temporada final del Tercer Doctor introdujo por primera vez el logo clásico de diamante que permanecería hasta 1980.