Secuencia Shine-Dalgarno

Posee una secuencia consenso característica: «AGGAGG», que es complementaria a una zona del 3' del ARN ribosomal 16S (denominada «secuencia anti-Shine-Dalgarno» y que posee por tanto la forma «UCCUCC»).

[1]​ La secuencia fue descrita por los investigadores australianos John Shine y Lynn Dalgarno en 1975.

[2]​ En eucariotas no existe una secuencia tan conservada, lo que ha llevado a sugerir que la interacción del ácido ribonucleico con el ribosoma ocurre en regiones próximas al extremo 5', desde donde el ribosoma se desliza hasta encontrar la secuencia Kozak,[3]​ iniciando la traducción en el codón AUG, contenido en dicha secuencia.

[4]​ Las mutaciones en la secuencia Shine-Dalgarno pueden reducir o aumentar la traducción en procariotas.

Dada la relación complementaria entre el ARNr y la secuencia de Shine-Dalgarno en el ARNm, se propuso que la secuencia en el extremo 3' del ARNr determina la capacidad del ribosoma procariótico para traducir un gen particular en un ARNm.