En biología molecular y bioinformática, la secuencia de consenso o secuencia canónica es el orden calculado más frecuente, ya sea de nucleótidos o aminoácidos, encontrado en cada posición en una alineación de secuencia.
ya que esta es, de todas las anteriores, la secuencia que representa las bases de mayor frecuencia absoluta en cada posición.
Tiene en cada lugar de la cadena, el aminoácido que está allí con mayor frecuencia en ejemplos diferentes.
Por tanto, ese aminoácido modal se escoge como el de elección en esa posición en el consenso.
Ejemplos de estas herramientas son JalView y UGENE.