Logo de secuencias

Para crear logos de secuencias, las secuencias relacionadas de ADN, ARN o proteínas, o bien secuencias de ADN que comparten lugares de unión conservados, son alineadas hasta que las partes más conservadas crean buenos alineamientos.Se puede crear entonces un logo de secuencias a partir del alineamiento múltiple de secuencias conservadas.Los residuos diferentes en la misma posición se escalarán de acuerdo a su frecuencia.Según lo visto, las letras de mayor altura representarán residuos únicos.Además, y por consenso, las bases más conservadas (las de mayor frecuencia de aparición y, por lo tanto, las más probables para esa determinada posición) se representan en la parte más alta de las pilas de residuos y, a la inversa, las menos conservadas irán ocupando, de forma proporcional, las posiciones inferiores.