Su actual equipo es el Club Universidad Nacional de la Liga MX, es hermano del también futbolista Ramiro Funes Mori.
Consiguió su primer gol en la victoria de su equipo por 2-0 frente a Tigre en ese mismo torneo.
Al siguiente torneo consigue cuatro goles, un triplete contra Racing Club[4] y el otro nuevamente frente a Tigre.
Ya jugando en la Primera B Nacional volvió a convertir un gol en la quinta fecha ante Defensa y Justicia para romper la sequía.
Convirtió su segundo gol en la séptima fecha ante Gimnasia y Esgrima de La Plata.
Su cuarto y último gol en la B Nacional se lo convirtió a Boca Unidos en la trigésima sexta fecha.
En agosto de 2013, tras ser apartado del plantel millonario por el entrenador Ramón Díaz, llega al conjunto portugués.
Al siguiente torneo, fue pieza importante para que Monterrey obtuviera el subcampeonato del Clausura 2016 anotando dos goles en la liguilla por el título, uno de ellos a los Tigres, en una nueva edición del Clásico Regiomontano que en esta ocasión su equipo ganaría por marcador de 3-1.
Además obtuvo la Copa MX en la edición del Apertura 2017 tras derrotar 1-0 al Pachuca en el Estadio BBVA Bancomer.
[16] Su primer partido fue ante un combinado de la Selección francesa Sub-23, en donde Funes Mori anotó dos goles para su equipo.
[23] En el 2001 dejó, junto con la familia, su Mendoza natal para buscar un mejor destino en los Estados Unidos.
El premio era llegar al FC Dallas, en donde estuvieron en las categorías inferiores.