Actualmente ostenta el puesto de máximo goleador extranjero en la historia del Alianza Lima.

Su buena temporada en Ecuador le valió ficha por el Estrella Roja de Belgrado.

Llegó a China al Shanghái Shenhua donde jugó 14 partidos y marcó 3 goles en la Super Liga China, además disputó 6 partidos y anotó 3 goles en la Liga de Campeones de la AFC.

En 2009 recibió el balón de diamante como goleador histórico de la Super Liga China en el Shenzhen Football Club con 113 partidos y 87 goles, lo cual hizo que la Liga de Quito se fijara en Barcos llegando a sus filas; jugó cuatro temporadas en el conjunto ecuatoriano,ganando una Recopa Sudamericana, además siendo goleador del torneo nacional con 65 anotaciones.

[5]​ El 21 de febrero marca un gol ante el Olmedo por la tercera fecha del campeonato ecuatoriano.

Tomando en cuenta la Serie A y los torneos internacionales oficiales es el máximo goleador en la historia de LDU con 90 tantos.

El 4 de noviembre Barcos marcó dos goles en el empate ante el Botafogo, metió un golazo que hizo llorar a los hinchas del Palmeiras, pues llega a los 27 goles que había prometido desde su llegada al Palmeiras.

El 19 de enero arranca el Campeonato Paulista Barcos debuta contra el Bragantino en un empate 0 a 0.

Al día siguiente fue presentado en el club donde usaría la dorsal 28, al igual que con el Palmeiras, en el día de su presentación se puso la meta de anotar, esta vez, 28 goles en el año (esta se la había propuesto con el Palmeiras).

[7]​ A inicios del 2021, Alianza Lima se encontraba armando el equipo para disputar la Liga 2 2021.

Sin embargo, tras un fallo emitido por el TAS, el club victoriano se mantenía en la Primera División del fútbol peruano.

La segunda parte del torneo nacional fue cuando el club íntimo llegó a su mejor nivel, permaneciendo en la cima de la Fase 2 por muchas fechas.

En la primera final del campeonato, Hernán anotó el gol que selló la victoria por 1-0.

Para el año siguiente, se proclamaría bicampeón siendo pieza clave y habitual titular para la obtención de dicho logro.

El 12 de octubre fue convocado por Alejandro Sabella para jugar frente a Uruguay por las Eliminatorias Mundialistas 2014; fue suplente y reemplazó a Gonzalo Higuaín en el segundo tiempo, incluso tuvo una ocasión definiendo por arriba de Fernando Muslera cuyo tiro terminaría en gol pero el árbitro anuló la jugada por offside.