Su nombre completo era Émile Henri Raphaël Duflos, y nació en Lille, Francia.

Como actor teatral, entró en la Comédie-Française en 1884, siendo miembro de la misma desde 1896 a 1924, y nombrado miembro honorario el 1 de enero de 1925.

Fue profesor del Conservatorio Nacional Superior de Arte Dramático, donde tuvo, entre otros destacados alumnos, a intérpretes como Huguette Duflos, Maurice Escande, Fernand Ledoux, Charles Boyer, Madeleine Renaud, Marie Bell, Edwige Feuillère y Annie Ducaux.

Raphaël Duflos falleció en París, Francia, en 1946.

Había estado casado con la actriz Huguette Duflos.