Ejerce también como Comandante en jefe de las Fuerzas Armadas del país africano.

[3]​ Khama permaneció en la presidencia hasta su muerte por cáncer de páncreas en 1980, y fue sucedido por el vicepresidente Quett Masire.

Khama respondió a la crisis con fuertes medidas de ajuste recomendadas por el Fondo Monetario Internacional, las cuales causaron un grave impacto en el importante sector público del país y debilitaron la popularidad del gobierno.

Entre las prioridades presentadas en su discurso al asumir la presidencia destacó la necesidad de reducir la dependencia del país del mercado de diamantes y el compromiso de su gobierno en ampliar el acceso a la educación técnica y establecer iniciativas en turismo, minería, carnes y servicios financieros.

Según el artículo 32, las candidaturas para la elección de un presidente se entregarán al oficial de escrutinio en el día y la hora que determine o establezca cualquier ley vigente en Botsuana; la candidatura de un candidato para una elección de un presidente no será válida a menos que esté apoyada, en la forma que determine o establezca una ley del Parlamento, por no menos de 1000 personas inscritas como votantes para las elecciones a la Asamblea.

Cuando la elección parlamentaria se dispute en cualquier circunscripción, se realizará una votación en esa circunscripción en la que los votos se emitirán por papeleta, y para los fines de esa votación, cualquier candidato parlamentario que declare su apoyo de conformidad a un candidato presidencial en particular utilizará el mismo color y símbolo de votación.

La sustitución del presidente de la República viene recogida en el artículo 35, así, si el presidente cesará en el cargo si en cualquier momento durante su mandato surgen circunstancias que, si no fuera miembro de la Asamblea Nacional, lo descalificarían para ser elegido para ella como pueden ser enfermedad, incapacidad o cese.

Cualquier persona que desempeñe las funciones del cargo de presidente en los casos mencionados anteriormente no podrá nombrar ni destituir al vicepresidente ni podrá disolver la Asamblea Nacional.

El sueldo y las prestaciones del presidente no se modificarán en su contra durante su mandato.

Mientras una persona ocupe o desempeñe las funciones del cargo de presidente, no se instituirá ni continuará ningún procedimiento penal contra ella por nada que haya hecho u omitido hacer en su carácter oficial o en su carácter privado, y no se instituirá ni continuará ningún procedimiento civil por el que se reclame reparación en su contra por nada que haya hecho u omitido hacer en su carácter privado.

En el ejercicio de cualquier función que le confiera esta Constitución o cualquier otra ley, el presidente actuará, a menos que se disponga otra cosa, según su propio criterio deliberado y no estará obligado a seguir el consejo ofrecido por ninguna otra persona o autoridad (artículo 47).

El presidente podrá, mediante instrucciones por escrito y sujeto a las condiciones que considere adecuadas, delegar en cualquier miembro de las fuerzas armadas cualquiera de los poderes mencionados (artículo 48).