Originalmente Rivera pensaba llegar a la Presidencia a través del recién fundado Partido Demócrata Cristiano, pero este, en sus fundamentos, contaba con un fuerte elemento antimilitarista y rechazaba cualquier alianza con la institución armada para llegar al poder.
Se produjo entonces una escisión dentro del PDC y varios de sus fundadores participaron en la creación del PCN, como José Ítalo Giammatei y José Vicente Vilanova, junto con otras figuras de derecha, como el diplomático Francisco José Guerrero, Enrique Sol Meza, Salvador Guerra Hercules y Dr. Rafael Armando Salinas.
Muchos miembros de esa organización también constituyeron el principal apoyo popular del partido Alianza Republicana Nacionalista, fundado en 1981.
Ganó las elecciones presidenciales de 1962 llevando como candidato al Coronel Julio Adalberto Rivera, quien gobernó hasta 1967.
En 1982 se celebraron elecciones para una Asamblea Constituyente que redactaría la actual Constitución de 1983.
Desde entonces el Partido de Conciliación Nacional se reorganizó y participó en todos los procesos electorales, logrando buenos resultados sobre todo en las zonas rurales de El Salvador, donde mantuvo sus votantes tradicionales.