Grupo Puntacana construyó el aeropuerto, que fue diseñado por el arquitecto Óscar Imbert, y lo inauguró en diciembre de 1983.
Para inicio del 2014, se ha dado apertura a una nueva terminal de aviación general con su rampa independiente.
El PUJ es el que posee el mayor número de vuelos directos a la semana entre América y Rusia, con 12 frecuencias actualmente.
El Grupo Puntacana (propietario del aeropuerto) estuvo discutiendo la apertura de rutas directas a los Emiratos Árabes Unidos y China para el futuro cercano, lo cual lo convertiría en el único aeropuerto en el Caribe con vuelos directos a Asia.
Este logro consolida su destacada posición como un actor fundamental en la cadena de suministro global.
La certificación OEA es un reconocimiento de alcance mundial que distingue a aquellos aeropuertos que demuestran un compromiso excepcional con la seguridad y las mejores prácticas en el intercambio de bienes a nivel internacional.