Inició vuelos nacionales a tres ciudades de Panamá utilizando un avión Douglas DC-3.

En la década de los 70 decide retirarse del mercado doméstico, dedicándose únicamente a operar destinos internacionales.

En 1980, y tras la compra de su primer avión, un Boeing 737-100, amplia sus destinos a Cartagena en Colombia, Puerto Príncipe en Haití, Santo Domingo, San Juan en Puerto Rico y Miami en los Estados Unidos.

Dos años después, inicia la renovación de su flota con aviones Boeing 737 Next Generation y amplía la red de destinos a Cancún, Orlando, São Paulo, Los Ángeles y San Andrés.

En 2003 recibe el primer Boeing 737-800 Next Generation y se amplía el acuerdo compartido con Continental Airlines.

Además, en el año 2010 anunció su integración a la red de aerolíneas Star Alliance, actualmente con 28 miembros.

Copa Airlines mantuvo su plan de expansión y agregó nueve destinos, dentro de los cuales están: Toronto, Porto Alegre, Brasilia, Nasáu, Montego Bay, Monterrey, Asunción, Chicago y Cúcuta.

[4]​[5]​[6]​ También lanzó su sitio móvil m.copaair.com, en el cual sus clientes pueden registrarse y obtener su pase de abordar,[n 1]​ verificar información sobre vuelos, entre otras características desde sus teléfonos móviles y anuncia un acuerdo de código compartido con la aerolínea ecuatoriana TAME, el cual será efectivo en el primer trimestre del 2012.

Además, recibe el nuevo Boeing 737-800 Next Generation Sky Interior con mejoras en el rendimiento, siendo la 1.ª aerolínea latinoamericana en tenerlo en su flota.

[7]​ Para el año 2012, 5 nuevos destinos: Las Vegas en Estados Unidos, Willemstad en Curazao, Liberia en Costa Rica, Recife en Brasil, y hacia Iquitos en Perú.

Es la segunda aerolínea latinoamericana en pedir el modelo, tras Aeromexico, que solicitó 90 unidades.

Esto amplía su red de rutas a 79 destinos en 32 países en Norte, Centro, Sur América y el Caribe.

Para el 2022 sumó tres nuevas rutas Santa Marta , Colombia y Barcelona ,Venezuela en septiembre inicio vuelos hacia el México-AIFA, México aconvirtiéndose en su destino 82 en 33 países en Norte, Centro, Sur América y el Caribe.

Copa Airlines es la tercera aerolínea en el mundo en recibir un Boeing 737 Next Generation con los Split Scimitar Winglets (HP-1836CMP).

Copa Airlines actualmente viaja a 89 destinos en 33 países, todos dentro del continente americano.

Copa Airlines actualmente posee código compartido con las siguientes aerolíneas:(Esta lista incluye aerolíneas que no pertenecen a la alianza Star Alliance) *- Miembro de Star Alliance.

Con un promedio anual del 90.29% en puntualidad, Copa Airlines se hizo acreedora a este reconocimiento por segundo año consecutivo, inclusive con estos resultados mejoró sus propios registros del 2013, año en el que logró 89.40% en puntualidad.