La arquidiócesis tiene como sufragáneas a las diócesis de: Bjelovar-Križevci, Sisak, Varaždin y a la eparquía de Križevci.La diócesis de Zagreb fue erigida en 1093 en el territorio de la antigua diócesis de Siscia (hoy Sisak), que había sido erigida en el siglo III y abandonada en el siglo VII.La erección de la diócesis se debe a una iniciativa del rey Ladislao I de Hungría, aliado del antipapa Clemente III.El desacuerdo con la Santa Sede que siguió fue resuelto solo en 1227 por el papa Gregorio IX.En 1511 se imprimió un Missale Zagrabiense, derivado del Missale Strigoniense de 1484, que permaneció en uso hasta 1788, cuando el Missale Strigoniense ya había caído en desuso durante 150 años.
