Cordovero estudió junto a Moisés de Trani, Joseph Sagis y Moshé Alshich.
La tradición cuenta que en 1542, a los veinte años, una "voz celeste" compelió al Ramaq a estudiar la Cábala al lado de su compañero el rabino, cabalista y poeta Salomón Halevi Alkabetz, también llamado Shlomo Halevi Alkabetz (fallecido en 1580, autor del famoso himno para recibir el Shabat, llamado "Lejá Dodí" (en español: "ven amado mío").
Por entonces redactó dos obras que le hicieron célebre: Or Yakar y Pardes Rimonim, finalizando esta última en 1548.
Cordovero dirigió la academia hasta su fallecimiento, que tuvo lugar veinte años más tarde.
Según otra tradición, Cordovero recibió frecuentes visitas del profeta Elías (Eliyahu Hanaví).